Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 KLRF1-208ENST00000617889 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 OR5D16-201ENST00000378396 987 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01014-203ENST00000455307 548 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
KRTAP9-3Q9BYQ3 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC9.46□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms