Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GABARAPL3Q9BY60 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GABARAPL3Q9BY60 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GABARAPL3Q9BY60 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GABARAPL3Q9BY60 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GABARAPL3Q9BY60 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GABARAPL3Q9BY60 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GABARAPL3Q9BY60 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GABARAPL3Q9BY60 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GABARAPL3Q9BY60 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GABARAPL3Q9BY60 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GABARAPL3Q9BY60 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GABARAPL3Q9BY60 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GABARAPL3Q9BY60 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GABARAPL3Q9BY60 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GABARAPL3Q9BY60 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GABARAPL3Q9BY60 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GABARAPL3Q9BY60 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GABARAPL3Q9BY60 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GABARAPL3Q9BY60 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GABARAPL3Q9BY60 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GABARAPL3Q9BY60 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GABARAPL3Q9BY60 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GABARAPL3Q9BY60 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GABARAPL3Q9BY60 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GABARAPL3Q9BY60 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GABARAPL3Q9BY60 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GABARAPL3Q9BY60 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GABARAPL3Q9BY60 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GABARAPL3Q9BY60 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GABARAPL3Q9BY60 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GABARAPL3Q9BY60 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GABARAPL3Q9BY60 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GABARAPL3Q9BY60 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GABARAPL3Q9BY60 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GABARAPL3Q9BY60 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GABARAPL3Q9BY60 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GABARAPL3Q9BY60 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GABARAPL3Q9BY60 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GABARAPL3Q9BY60 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GABARAPL3Q9BY60 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GABARAPL3Q9BY60 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GABARAPL3Q9BY60 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GABARAPL3Q9BY60 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GABARAPL3Q9BY60 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GABARAPL3Q9BY60 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GABARAPL3Q9BY60 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GABARAPL3Q9BY60 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GABARAPL3Q9BY60 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GABARAPL3Q9BY60 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GABARAPL3Q9BY60 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GABARAPL3Q9BY60 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GABARAPL3Q9BY60 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GABARAPL3Q9BY60 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GABARAPL3Q9BY60 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GABARAPL3Q9BY60 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GABARAPL3Q9BY60 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GABARAPL3Q9BY60 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GABARAPL3Q9BY60 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GABARAPL3Q9BY60 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GABARAPL3Q9BY60 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GABARAPL3Q9BY60 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GABARAPL3Q9BY60 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GABARAPL3Q9BY60 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GABARAPL3Q9BY60 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GABARAPL3Q9BY60 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GABARAPL3Q9BY60 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GABARAPL3Q9BY60 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GABARAPL3Q9BY60 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GABARAPL3Q9BY60 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GABARAPL3Q9BY60 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GABARAPL3Q9BY60 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GABARAPL3Q9BY60 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GABARAPL3Q9BY60 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GABARAPL3Q9BY60 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GABARAPL3Q9BY60 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GABARAPL3Q9BY60 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GABARAPL3Q9BY60 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GABARAPL3Q9BY60 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GABARAPL3Q9BY60 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GABARAPL3Q9BY60 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GABARAPL3Q9BY60 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GABARAPL3Q9BY60 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GABARAPL3Q9BY60 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GABARAPL3Q9BY60 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GABARAPL3Q9BY60 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GABARAPL3Q9BY60 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GABARAPL3Q9BY60 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GABARAPL3Q9BY60 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GABARAPL3Q9BY60 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GABARAPL3Q9BY60 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GABARAPL3Q9BY60 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GABARAPL3Q9BY60 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GABARAPL3Q9BY60 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GABARAPL3Q9BY60 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GABARAPL3Q9BY60 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GABARAPL3Q9BY60 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GABARAPL3Q9BY60 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
GABARAPL3Q9BY60 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
GABARAPL3Q9BY60 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms