Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PACSIN1Q9BY11 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PACSIN1Q9BY11 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PACSIN1Q9BY11 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PACSIN1Q9BY11 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PACSIN1Q9BY11 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PACSIN1Q9BY11 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PACSIN1Q9BY11 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PACSIN1Q9BY11 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PACSIN1Q9BY11 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PACSIN1Q9BY11 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PACSIN1Q9BY11 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PACSIN1Q9BY11 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PACSIN1Q9BY11 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PACSIN1Q9BY11 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PACSIN1Q9BY11 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PACSIN1Q9BY11 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PACSIN1Q9BY11 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PACSIN1Q9BY11 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PACSIN1Q9BY11 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PACSIN1Q9BY11 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PACSIN1Q9BY11 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PACSIN1Q9BY11 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PACSIN1Q9BY11 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PACSIN1Q9BY11 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PACSIN1Q9BY11 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PACSIN1Q9BY11 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PACSIN1Q9BY11 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PACSIN1Q9BY11 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PACSIN1Q9BY11 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PACSIN1Q9BY11 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PACSIN1Q9BY11 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PACSIN1Q9BY11 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PACSIN1Q9BY11 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PACSIN1Q9BY11 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PACSIN1Q9BY11 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PACSIN1Q9BY11 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PACSIN1Q9BY11 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PACSIN1Q9BY11 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PACSIN1Q9BY11 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PACSIN1Q9BY11 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PACSIN1Q9BY11 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PACSIN1Q9BY11 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PACSIN1Q9BY11 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PACSIN1Q9BY11 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PACSIN1Q9BY11 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PACSIN1Q9BY11 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PACSIN1Q9BY11 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PACSIN1Q9BY11 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PACSIN1Q9BY11 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PACSIN1Q9BY11 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PACSIN1Q9BY11 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PACSIN1Q9BY11 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PACSIN1Q9BY11 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PACSIN1Q9BY11 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PACSIN1Q9BY11 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PACSIN1Q9BY11 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PACSIN1Q9BY11 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PACSIN1Q9BY11 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PACSIN1Q9BY11 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PACSIN1Q9BY11 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PACSIN1Q9BY11 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PACSIN1Q9BY11 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PACSIN1Q9BY11 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PACSIN1Q9BY11 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PACSIN1Q9BY11 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PACSIN1Q9BY11 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PACSIN1Q9BY11 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PACSIN1Q9BY11 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PACSIN1Q9BY11 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PACSIN1Q9BY11 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PACSIN1Q9BY11 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PACSIN1Q9BY11 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PACSIN1Q9BY11 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PACSIN1Q9BY11 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PACSIN1Q9BY11 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PACSIN1Q9BY11 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PACSIN1Q9BY11 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PACSIN1Q9BY11 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PACSIN1Q9BY11 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PACSIN1Q9BY11 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PACSIN1Q9BY11 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PACSIN1Q9BY11 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PACSIN1Q9BY11 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PACSIN1Q9BY11 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PACSIN1Q9BY11 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PACSIN1Q9BY11 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PACSIN1Q9BY11 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PACSIN1Q9BY11 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PACSIN1Q9BY11 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PACSIN1Q9BY11 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PACSIN1Q9BY11 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PACSIN1Q9BY11 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PACSIN1Q9BY11 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PACSIN1Q9BY11 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PACSIN1Q9BY11 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PACSIN1Q9BY11 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PACSIN1Q9BY11 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PACSIN1Q9BY11 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PACSIN1Q9BY11 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
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