Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX40

LSM14B, Protein LSM14 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM14BQ9BX40 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LSM14BQ9BX40 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LSM14BQ9BX40 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LSM14BQ9BX40 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LSM14BQ9BX40 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LSM14BQ9BX40 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LSM14BQ9BX40 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LSM14BQ9BX40 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LSM14BQ9BX40 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LSM14BQ9BX40 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LSM14BQ9BX40 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LSM14BQ9BX40 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LSM14BQ9BX40 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LSM14BQ9BX40 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LSM14BQ9BX40 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LSM14BQ9BX40 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LSM14BQ9BX40 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LSM14BQ9BX40 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LSM14BQ9BX40 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LSM14BQ9BX40 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LSM14BQ9BX40 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LSM14BQ9BX40 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LSM14BQ9BX40 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LSM14BQ9BX40 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LSM14BQ9BX40 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LSM14BQ9BX40 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LSM14BQ9BX40 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LSM14BQ9BX40 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LSM14BQ9BX40 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LSM14BQ9BX40 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LSM14BQ9BX40 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LSM14BQ9BX40 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LSM14BQ9BX40 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LSM14BQ9BX40 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LSM14BQ9BX40 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LSM14BQ9BX40 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LSM14BQ9BX40 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LSM14BQ9BX40 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LSM14BQ9BX40 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LSM14BQ9BX40 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LSM14BQ9BX40 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LSM14BQ9BX40 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LSM14BQ9BX40 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LSM14BQ9BX40 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LSM14BQ9BX40 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LSM14BQ9BX40 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LSM14BQ9BX40 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LSM14BQ9BX40 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LSM14BQ9BX40 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LSM14BQ9BX40 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LSM14BQ9BX40 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LSM14BQ9BX40 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LSM14BQ9BX40 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LSM14BQ9BX40 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LSM14BQ9BX40 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LSM14BQ9BX40 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LSM14BQ9BX40 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LSM14BQ9BX40 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LSM14BQ9BX40 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LSM14BQ9BX40 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LSM14BQ9BX40 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LSM14BQ9BX40 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LSM14BQ9BX40 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LSM14BQ9BX40 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LSM14BQ9BX40 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LSM14BQ9BX40 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LSM14BQ9BX40 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LSM14BQ9BX40 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LSM14BQ9BX40 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LSM14BQ9BX40 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LSM14BQ9BX40 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LSM14BQ9BX40 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LSM14BQ9BX40 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LSM14BQ9BX40 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LSM14BQ9BX40 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LSM14BQ9BX40 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LSM14BQ9BX40 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LSM14BQ9BX40 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LSM14BQ9BX40 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LSM14BQ9BX40 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LSM14BQ9BX40 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LSM14BQ9BX40 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LSM14BQ9BX40 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LSM14BQ9BX40 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LSM14BQ9BX40 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LSM14BQ9BX40 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LSM14BQ9BX40 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LSM14BQ9BX40 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LSM14BQ9BX40 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LSM14BQ9BX40 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LSM14BQ9BX40 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LSM14BQ9BX40 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LSM14BQ9BX40 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LSM14BQ9BX40 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LSM14BQ9BX40 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LSM14BQ9BX40 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LSM14BQ9BX40 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LSM14BQ9BX40 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LSM14BQ9BX40 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LSM14BQ9BX40 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.8 ms