Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU64

CENPO, Centromere protein O, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPOQ9BU64 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPOQ9BU64 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPOQ9BU64 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPOQ9BU64 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPOQ9BU64 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPOQ9BU64 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPOQ9BU64 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPOQ9BU64 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPOQ9BU64 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPOQ9BU64 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPOQ9BU64 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPOQ9BU64 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPOQ9BU64 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPOQ9BU64 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPOQ9BU64 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPOQ9BU64 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPOQ9BU64 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPOQ9BU64 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPOQ9BU64 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPOQ9BU64 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPOQ9BU64 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CENPOQ9BU64 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CENPOQ9BU64 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CENPOQ9BU64 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CENPOQ9BU64 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CENPOQ9BU64 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CENPOQ9BU64 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CENPOQ9BU64 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CENPOQ9BU64 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CENPOQ9BU64 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CENPOQ9BU64 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CENPOQ9BU64 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CENPOQ9BU64 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CENPOQ9BU64 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CENPOQ9BU64 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CENPOQ9BU64 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CENPOQ9BU64 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CENPOQ9BU64 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CENPOQ9BU64 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CENPOQ9BU64 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CENPOQ9BU64 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CENPOQ9BU64 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CENPOQ9BU64 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CENPOQ9BU64 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CENPOQ9BU64 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CENPOQ9BU64 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CENPOQ9BU64 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CENPOQ9BU64 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CENPOQ9BU64 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CENPOQ9BU64 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CENPOQ9BU64 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CENPOQ9BU64 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CENPOQ9BU64 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CENPOQ9BU64 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CENPOQ9BU64 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CENPOQ9BU64 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CENPOQ9BU64 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CENPOQ9BU64 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CENPOQ9BU64 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CENPOQ9BU64 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CENPOQ9BU64 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CENPOQ9BU64 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CENPOQ9BU64 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CENPOQ9BU64 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CENPOQ9BU64 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CENPOQ9BU64 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CENPOQ9BU64 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CENPOQ9BU64 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CENPOQ9BU64 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CENPOQ9BU64 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CENPOQ9BU64 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CENPOQ9BU64 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CENPOQ9BU64 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CENPOQ9BU64 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CENPOQ9BU64 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CENPOQ9BU64 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CENPOQ9BU64 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CENPOQ9BU64 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CENPOQ9BU64 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CENPOQ9BU64 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CENPOQ9BU64 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CENPOQ9BU64 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CENPOQ9BU64 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CENPOQ9BU64 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CENPOQ9BU64 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CENPOQ9BU64 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CENPOQ9BU64 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CENPOQ9BU64 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CENPOQ9BU64 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CENPOQ9BU64 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CENPOQ9BU64 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CENPOQ9BU64 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CENPOQ9BU64 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CENPOQ9BU64 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CENPOQ9BU64 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CENPOQ9BU64 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CENPOQ9BU64 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CENPOQ9BU64 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CENPOQ9BU64 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CENPOQ9BU64 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms