Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD1

SHANK2-AS3, Putative uncharacterized protein SHANK2-AS3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2-AS3Q9BTD1 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SHANK2-AS3Q9BTD1 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms