Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRN9

TM2D3, TM2 domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM2D3Q9BRN9 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TM2D3Q9BRN9 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TM2D3Q9BRN9 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TM2D3Q9BRN9 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TM2D3Q9BRN9 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TM2D3Q9BRN9 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TM2D3Q9BRN9 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TM2D3Q9BRN9 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TM2D3Q9BRN9 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TM2D3Q9BRN9 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TM2D3Q9BRN9 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TM2D3Q9BRN9 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TM2D3Q9BRN9 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TM2D3Q9BRN9 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TM2D3Q9BRN9 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TM2D3Q9BRN9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TM2D3Q9BRN9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TM2D3Q9BRN9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TM2D3Q9BRN9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TM2D3Q9BRN9 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TM2D3Q9BRN9 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TM2D3Q9BRN9 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TM2D3Q9BRN9 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TM2D3Q9BRN9 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TM2D3Q9BRN9 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TM2D3Q9BRN9 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TM2D3Q9BRN9 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TM2D3Q9BRN9 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TM2D3Q9BRN9 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TM2D3Q9BRN9 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TM2D3Q9BRN9 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TM2D3Q9BRN9 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TM2D3Q9BRN9 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TM2D3Q9BRN9 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TM2D3Q9BRN9 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TM2D3Q9BRN9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TM2D3Q9BRN9 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TM2D3Q9BRN9 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TM2D3Q9BRN9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TM2D3Q9BRN9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TM2D3Q9BRN9 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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TM2D3Q9BRN9 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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TM2D3Q9BRN9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TM2D3Q9BRN9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TM2D3Q9BRN9 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TM2D3Q9BRN9 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TM2D3Q9BRN9 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TM2D3Q9BRN9 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TM2D3Q9BRN9 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TM2D3Q9BRN9 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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TM2D3Q9BRN9 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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TM2D3Q9BRN9 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TM2D3Q9BRN9 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TM2D3Q9BRN9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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TM2D3Q9BRN9 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TM2D3Q9BRN9 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TM2D3Q9BRN9 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TM2D3Q9BRN9 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TM2D3Q9BRN9 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TM2D3Q9BRN9 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
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TM2D3Q9BRN9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TM2D3Q9BRN9 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TM2D3Q9BRN9 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TM2D3Q9BRN9 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TM2D3Q9BRN9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TM2D3Q9BRN9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TM2D3Q9BRN9 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TM2D3Q9BRN9 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TM2D3Q9BRN9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TM2D3Q9BRN9 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TM2D3Q9BRN9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TM2D3Q9BRN9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TM2D3Q9BRN9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TM2D3Q9BRN9 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TM2D3Q9BRN9 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TM2D3Q9BRN9 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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