Protein–RNA interactions for Protein: Q99999

GAL3ST1, Galactosylceramide sulfotransferase, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAL3ST1Q99999 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GAL3ST1Q99999 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GAL3ST1Q99999 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GAL3ST1Q99999 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GAL3ST1Q99999 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GAL3ST1Q99999 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GAL3ST1Q99999 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GAL3ST1Q99999 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GAL3ST1Q99999 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GAL3ST1Q99999 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GAL3ST1Q99999 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GAL3ST1Q99999 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GAL3ST1Q99999 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GAL3ST1Q99999 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GAL3ST1Q99999 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GAL3ST1Q99999 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GAL3ST1Q99999 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GAL3ST1Q99999 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GAL3ST1Q99999 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GAL3ST1Q99999 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GAL3ST1Q99999 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GAL3ST1Q99999 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GAL3ST1Q99999 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GAL3ST1Q99999 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GAL3ST1Q99999 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GAL3ST1Q99999 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GAL3ST1Q99999 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GAL3ST1Q99999 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GAL3ST1Q99999 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GAL3ST1Q99999 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GAL3ST1Q99999 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GAL3ST1Q99999 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GAL3ST1Q99999 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GAL3ST1Q99999 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GAL3ST1Q99999 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GAL3ST1Q99999 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GAL3ST1Q99999 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GAL3ST1Q99999 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GAL3ST1Q99999 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GAL3ST1Q99999 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GAL3ST1Q99999 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GAL3ST1Q99999 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GAL3ST1Q99999 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GAL3ST1Q99999 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GAL3ST1Q99999 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GAL3ST1Q99999 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GAL3ST1Q99999 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GAL3ST1Q99999 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GAL3ST1Q99999 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GAL3ST1Q99999 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GAL3ST1Q99999 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GAL3ST1Q99999 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GAL3ST1Q99999 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GAL3ST1Q99999 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GAL3ST1Q99999 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GAL3ST1Q99999 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GAL3ST1Q99999 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GAL3ST1Q99999 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GAL3ST1Q99999 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GAL3ST1Q99999 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GAL3ST1Q99999 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GAL3ST1Q99999 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GAL3ST1Q99999 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GAL3ST1Q99999 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GAL3ST1Q99999 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GAL3ST1Q99999 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GAL3ST1Q99999 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GAL3ST1Q99999 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GAL3ST1Q99999 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GAL3ST1Q99999 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GAL3ST1Q99999 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GAL3ST1Q99999 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GAL3ST1Q99999 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GAL3ST1Q99999 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GAL3ST1Q99999 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GAL3ST1Q99999 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GAL3ST1Q99999 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GAL3ST1Q99999 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GAL3ST1Q99999 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GAL3ST1Q99999 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GAL3ST1Q99999 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GAL3ST1Q99999 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GAL3ST1Q99999 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GAL3ST1Q99999 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GAL3ST1Q99999 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GAL3ST1Q99999 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GAL3ST1Q99999 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GAL3ST1Q99999 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GAL3ST1Q99999 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GAL3ST1Q99999 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
GAL3ST1Q99999 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GAL3ST1Q99999 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
GAL3ST1Q99999 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GAL3ST1Q99999 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GAL3ST1Q99999 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GAL3ST1Q99999 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GAL3ST1Q99999 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GAL3ST1Q99999 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GAL3ST1Q99999 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GAL3ST1Q99999 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms