Protein–RNA interactions for Protein: Q99988

GDF15, Growth/differentiation factor 15, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF15Q99988 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GDF15Q99988 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GDF15Q99988 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GDF15Q99988 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GDF15Q99988 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GDF15Q99988 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GDF15Q99988 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GDF15Q99988 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GDF15Q99988 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GDF15Q99988 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GDF15Q99988 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GDF15Q99988 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GDF15Q99988 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GDF15Q99988 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GDF15Q99988 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GDF15Q99988 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GDF15Q99988 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GDF15Q99988 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GDF15Q99988 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GDF15Q99988 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GDF15Q99988 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GDF15Q99988 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GDF15Q99988 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GDF15Q99988 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GDF15Q99988 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GDF15Q99988 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GDF15Q99988 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GDF15Q99988 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GDF15Q99988 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GDF15Q99988 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GDF15Q99988 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GDF15Q99988 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GDF15Q99988 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GDF15Q99988 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GDF15Q99988 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GDF15Q99988 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GDF15Q99988 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GDF15Q99988 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GDF15Q99988 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GDF15Q99988 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GDF15Q99988 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GDF15Q99988 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GDF15Q99988 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GDF15Q99988 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GDF15Q99988 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GDF15Q99988 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GDF15Q99988 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GDF15Q99988 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GDF15Q99988 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GDF15Q99988 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GDF15Q99988 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GDF15Q99988 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GDF15Q99988 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GDF15Q99988 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GDF15Q99988 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GDF15Q99988 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GDF15Q99988 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GDF15Q99988 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GDF15Q99988 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GDF15Q99988 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GDF15Q99988 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GDF15Q99988 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GDF15Q99988 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GDF15Q99988 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GDF15Q99988 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GDF15Q99988 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GDF15Q99988 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GDF15Q99988 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GDF15Q99988 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GDF15Q99988 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
GDF15Q99988 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GDF15Q99988 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GDF15Q99988 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GDF15Q99988 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GDF15Q99988 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GDF15Q99988 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GDF15Q99988 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GDF15Q99988 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GDF15Q99988 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GDF15Q99988 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GDF15Q99988 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GDF15Q99988 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GDF15Q99988 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GDF15Q99988 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GDF15Q99988 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GDF15Q99988 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GDF15Q99988 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GDF15Q99988 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GDF15Q99988 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GDF15Q99988 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GDF15Q99988 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GDF15Q99988 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GDF15Q99988 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GDF15Q99988 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GDF15Q99988 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GDF15Q99988 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GDF15Q99988 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GDF15Q99988 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GDF15Q99988 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GDF15Q99988 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms