Protein–RNA interactions for Protein: Q99758

ABCA3, ATP-binding cassette sub-family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCA3Q99758 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ABCA3Q99758 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ABCA3Q99758 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ABCA3Q99758 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ABCA3Q99758 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ABCA3Q99758 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ABCA3Q99758 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ABCA3Q99758 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
ABCA3Q99758 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ABCA3Q99758 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ABCA3Q99758 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ABCA3Q99758 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ABCA3Q99758 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ABCA3Q99758 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ABCA3Q99758 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
ABCA3Q99758 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ABCA3Q99758 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ABCA3Q99758 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ABCA3Q99758 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ABCA3Q99758 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ABCA3Q99758 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ABCA3Q99758 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ABCA3Q99758 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ABCA3Q99758 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ABCA3Q99758 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ABCA3Q99758 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
ABCA3Q99758 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ABCA3Q99758 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ABCA3Q99758 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ABCA3Q99758 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ABCA3Q99758 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ABCA3Q99758 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ABCA3Q99758 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ABCA3Q99758 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ABCA3Q99758 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
ABCA3Q99758 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ABCA3Q99758 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ABCA3Q99758 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ABCA3Q99758 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ABCA3Q99758 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ABCA3Q99758 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ABCA3Q99758 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
ABCA3Q99758 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ABCA3Q99758 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ABCA3Q99758 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ABCA3Q99758 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ABCA3Q99758 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ABCA3Q99758 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ABCA3Q99758 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ABCA3Q99758 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ABCA3Q99758 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ABCA3Q99758 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ABCA3Q99758 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ABCA3Q99758 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ABCA3Q99758 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ABCA3Q99758 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ABCA3Q99758 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ABCA3Q99758 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ABCA3Q99758 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
ABCA3Q99758 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ABCA3Q99758 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ABCA3Q99758 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ABCA3Q99758 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ABCA3Q99758 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ABCA3Q99758 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ABCA3Q99758 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ABCA3Q99758 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ABCA3Q99758 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ABCA3Q99758 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ABCA3Q99758 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ABCA3Q99758 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
ABCA3Q99758 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ABCA3Q99758 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ABCA3Q99758 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
ABCA3Q99758 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ABCA3Q99758 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ABCA3Q99758 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ABCA3Q99758 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
ABCA3Q99758 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ABCA3Q99758 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ABCA3Q99758 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ABCA3Q99758 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ABCA3Q99758 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ABCA3Q99758 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ABCA3Q99758 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ABCA3Q99758 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ABCA3Q99758 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
ABCA3Q99758 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ABCA3Q99758 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ABCA3Q99758 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ABCA3Q99758 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ABCA3Q99758 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ABCA3Q99758 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ABCA3Q99758 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ABCA3Q99758 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ABCA3Q99758 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ABCA3Q99758 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ABCA3Q99758 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ABCA3Q99758 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ABCA3Q99758 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms