Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MEIS3Q99687 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MEIS3Q99687 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MEIS3Q99687 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MEIS3Q99687 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MEIS3Q99687 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
MEIS3Q99687 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MEIS3Q99687 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MEIS3Q99687 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MEIS3Q99687 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MEIS3Q99687 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MEIS3Q99687 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
MEIS3Q99687 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MEIS3Q99687 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MEIS3Q99687 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MEIS3Q99687 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MEIS3Q99687 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
MEIS3Q99687 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
MEIS3Q99687 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MEIS3Q99687 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MEIS3Q99687 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MEIS3Q99687 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MEIS3Q99687 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MEIS3Q99687 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MEIS3Q99687 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MEIS3Q99687 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MEIS3Q99687 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MEIS3Q99687 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MEIS3Q99687 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MEIS3Q99687 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MEIS3Q99687 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MEIS3Q99687 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MEIS3Q99687 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MEIS3Q99687 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MEIS3Q99687 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MEIS3Q99687 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MEIS3Q99687 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MEIS3Q99687 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MEIS3Q99687 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
MEIS3Q99687 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
MEIS3Q99687 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
MEIS3Q99687 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
MEIS3Q99687 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MEIS3Q99687 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MEIS3Q99687 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MEIS3Q99687 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MEIS3Q99687 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MEIS3Q99687 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MEIS3Q99687 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
MEIS3Q99687 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
MEIS3Q99687 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MEIS3Q99687 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MEIS3Q99687 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MEIS3Q99687 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MEIS3Q99687 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MEIS3Q99687 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MEIS3Q99687 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MEIS3Q99687 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MEIS3Q99687 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
MEIS3Q99687 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MEIS3Q99687 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MEIS3Q99687 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MEIS3Q99687 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MEIS3Q99687 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
MEIS3Q99687 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MEIS3Q99687 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MEIS3Q99687 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MEIS3Q99687 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MEIS3Q99687 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MEIS3Q99687 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MEIS3Q99687 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MEIS3Q99687 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MEIS3Q99687 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MEIS3Q99687 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MEIS3Q99687 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
MEIS3Q99687 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MEIS3Q99687 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MEIS3Q99687 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MEIS3Q99687 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MEIS3Q99687 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MEIS3Q99687 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MEIS3Q99687 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
MEIS3Q99687 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MEIS3Q99687 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MEIS3Q99687 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MEIS3Q99687 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MEIS3Q99687 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MEIS3Q99687 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MEIS3Q99687 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MEIS3Q99687 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MEIS3Q99687 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MEIS3Q99687 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MEIS3Q99687 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MEIS3Q99687 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MEIS3Q99687 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MEIS3Q99687 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MEIS3Q99687 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MEIS3Q99687 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
MEIS3Q99687 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
MEIS3Q99687 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms