Protein–RNA interactions for Protein: Q99638

RAD9A, Cell cycle checkpoint control protein RAD9A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD9AQ99638 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RAD9AQ99638 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAD9AQ99638 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAD9AQ99638 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAD9AQ99638 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAD9AQ99638 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RAD9AQ99638 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAD9AQ99638 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAD9AQ99638 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAD9AQ99638 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAD9AQ99638 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAD9AQ99638 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RAD9AQ99638 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAD9AQ99638 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAD9AQ99638 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAD9AQ99638 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAD9AQ99638 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RAD9AQ99638 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAD9AQ99638 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAD9AQ99638 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAD9AQ99638 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAD9AQ99638 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAD9AQ99638 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAD9AQ99638 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAD9AQ99638 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAD9AQ99638 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAD9AQ99638 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAD9AQ99638 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAD9AQ99638 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAD9AQ99638 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAD9AQ99638 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAD9AQ99638 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAD9AQ99638 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RAD9AQ99638 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAD9AQ99638 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAD9AQ99638 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RAD9AQ99638 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAD9AQ99638 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAD9AQ99638 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RAD9AQ99638 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAD9AQ99638 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAD9AQ99638 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAD9AQ99638 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAD9AQ99638 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAD9AQ99638 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAD9AQ99638 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAD9AQ99638 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RAD9AQ99638 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAD9AQ99638 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAD9AQ99638 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAD9AQ99638 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAD9AQ99638 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RAD9AQ99638 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAD9AQ99638 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAD9AQ99638 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAD9AQ99638 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAD9AQ99638 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAD9AQ99638 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAD9AQ99638 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAD9AQ99638 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD9AQ99638 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD9AQ99638 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD9AQ99638 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD9AQ99638 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD9AQ99638 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD9AQ99638 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD9AQ99638 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD9AQ99638 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD9AQ99638 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD9AQ99638 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD9AQ99638 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD9AQ99638 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD9AQ99638 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD9AQ99638 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD9AQ99638 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD9AQ99638 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD9AQ99638 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD9AQ99638 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD9AQ99638 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD9AQ99638 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD9AQ99638 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAD9AQ99638 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAD9AQ99638 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAD9AQ99638 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAD9AQ99638 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAD9AQ99638 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAD9AQ99638 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAD9AQ99638 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RAD9AQ99638 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAD9AQ99638 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAD9AQ99638 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAD9AQ99638 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RAD9AQ99638 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAD9AQ99638 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAD9AQ99638 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAD9AQ99638 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAD9AQ99638 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RAD9AQ99638 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RAD9AQ99638 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RAD9AQ99638 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms