Protein–RNA interactions for Protein: Q99570

PIK3R4, Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3R4Q99570 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PIK3R4Q99570 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PIK3R4Q99570 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PIK3R4Q99570 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PIK3R4Q99570 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PIK3R4Q99570 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PIK3R4Q99570 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PIK3R4Q99570 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
PIK3R4Q99570 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PIK3R4Q99570 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PIK3R4Q99570 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PIK3R4Q99570 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PIK3R4Q99570 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PIK3R4Q99570 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
PIK3R4Q99570 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PIK3R4Q99570 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PIK3R4Q99570 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PIK3R4Q99570 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PIK3R4Q99570 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PIK3R4Q99570 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PIK3R4Q99570 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PIK3R4Q99570 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PIK3R4Q99570 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PIK3R4Q99570 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
PIK3R4Q99570 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PIK3R4Q99570 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PIK3R4Q99570 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PIK3R4Q99570 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PIK3R4Q99570 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PIK3R4Q99570 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PIK3R4Q99570 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PIK3R4Q99570 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PIK3R4Q99570 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PIK3R4Q99570 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PIK3R4Q99570 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PIK3R4Q99570 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PIK3R4Q99570 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PIK3R4Q99570 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PIK3R4Q99570 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PIK3R4Q99570 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PIK3R4Q99570 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PIK3R4Q99570 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PIK3R4Q99570 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PIK3R4Q99570 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PIK3R4Q99570 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PIK3R4Q99570 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PIK3R4Q99570 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PIK3R4Q99570 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PIK3R4Q99570 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PIK3R4Q99570 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PIK3R4Q99570 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PIK3R4Q99570 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PIK3R4Q99570 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PIK3R4Q99570 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PIK3R4Q99570 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PIK3R4Q99570 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PIK3R4Q99570 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PIK3R4Q99570 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PIK3R4Q99570 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PIK3R4Q99570 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PIK3R4Q99570 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PIK3R4Q99570 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PIK3R4Q99570 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PIK3R4Q99570 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PIK3R4Q99570 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PIK3R4Q99570 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PIK3R4Q99570 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PIK3R4Q99570 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PIK3R4Q99570 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PIK3R4Q99570 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PIK3R4Q99570 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PIK3R4Q99570 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PIK3R4Q99570 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PIK3R4Q99570 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PIK3R4Q99570 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PIK3R4Q99570 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PIK3R4Q99570 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PIK3R4Q99570 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PIK3R4Q99570 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PIK3R4Q99570 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PIK3R4Q99570 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PIK3R4Q99570 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PIK3R4Q99570 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PIK3R4Q99570 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PIK3R4Q99570 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PIK3R4Q99570 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PIK3R4Q99570 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PIK3R4Q99570 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PIK3R4Q99570 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PIK3R4Q99570 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
PIK3R4Q99570 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PIK3R4Q99570 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PIK3R4Q99570 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
PIK3R4Q99570 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PIK3R4Q99570 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PIK3R4Q99570 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PIK3R4Q99570 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PIK3R4Q99570 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PIK3R4Q99570 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PIK3R4Q99570 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms