Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PHF12Q96QT6 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PHF12Q96QT6 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PHF12Q96QT6 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PHF12Q96QT6 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PHF12Q96QT6 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PHF12Q96QT6 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PHF12Q96QT6 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PHF12Q96QT6 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PHF12Q96QT6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PHF12Q96QT6 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PHF12Q96QT6 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PHF12Q96QT6 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PHF12Q96QT6 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PHF12Q96QT6 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PHF12Q96QT6 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PHF12Q96QT6 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PHF12Q96QT6 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PHF12Q96QT6 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PHF12Q96QT6 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PHF12Q96QT6 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PHF12Q96QT6 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PHF12Q96QT6 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PHF12Q96QT6 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PHF12Q96QT6 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PHF12Q96QT6 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PHF12Q96QT6 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PHF12Q96QT6 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PHF12Q96QT6 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PHF12Q96QT6 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PHF12Q96QT6 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PHF12Q96QT6 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PHF12Q96QT6 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PHF12Q96QT6 OR13I1P-201ENST00000609811 1264 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PHF12Q96QT6 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PHF12Q96QT6 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PHF12Q96QT6 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PHF12Q96QT6 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PHF12Q96QT6 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PHF12Q96QT6 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PHF12Q96QT6 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PHF12Q96QT6 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PHF12Q96QT6 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PHF12Q96QT6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PHF12Q96QT6 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PHF12Q96QT6 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PHF12Q96QT6 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PHF12Q96QT6 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PHF12Q96QT6 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PHF12Q96QT6 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PHF12Q96QT6 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PHF12Q96QT6 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PHF12Q96QT6 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PHF12Q96QT6 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PHF12Q96QT6 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PHF12Q96QT6 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PHF12Q96QT6 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PHF12Q96QT6 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PHF12Q96QT6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PHF12Q96QT6 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PHF12Q96QT6 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PHF12Q96QT6 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PHF12Q96QT6 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PHF12Q96QT6 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PHF12Q96QT6 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PHF12Q96QT6 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PHF12Q96QT6 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PHF12Q96QT6 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PHF12Q96QT6 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PHF12Q96QT6 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PHF12Q96QT6 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PHF12Q96QT6 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PHF12Q96QT6 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PHF12Q96QT6 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PHF12Q96QT6 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PHF12Q96QT6 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PHF12Q96QT6 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PHF12Q96QT6 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PHF12Q96QT6 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PHF12Q96QT6 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PHF12Q96QT6 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PHF12Q96QT6 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PHF12Q96QT6 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PHF12Q96QT6 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PHF12Q96QT6 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PHF12Q96QT6 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PHF12Q96QT6 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PHF12Q96QT6 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PHF12Q96QT6 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PHF12Q96QT6 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PHF12Q96QT6 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PHF12Q96QT6 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PHF12Q96QT6 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PHF12Q96QT6 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PHF12Q96QT6 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PHF12Q96QT6 Z97985.1-201ENST00000332270 946 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
PHF12Q96QT6 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PHF12Q96QT6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PHF12Q96QT6 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms