Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q42

ALS2, Alsin, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2Q96Q42 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ALS2Q96Q42 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ALS2Q96Q42 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
ALS2Q96Q42 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ALS2Q96Q42 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ALS2Q96Q42 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ALS2Q96Q42 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ALS2Q96Q42 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ALS2Q96Q42 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ALS2Q96Q42 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
ALS2Q96Q42 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ALS2Q96Q42 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ALS2Q96Q42 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ALS2Q96Q42 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ALS2Q96Q42 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ALS2Q96Q42 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ALS2Q96Q42 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ALS2Q96Q42 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
ALS2Q96Q42 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ALS2Q96Q42 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ALS2Q96Q42 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ALS2Q96Q42 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ALS2Q96Q42 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ALS2Q96Q42 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
ALS2Q96Q42 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ALS2Q96Q42 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ALS2Q96Q42 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ALS2Q96Q42 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ALS2Q96Q42 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ALS2Q96Q42 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ALS2Q96Q42 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ALS2Q96Q42 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ALS2Q96Q42 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ALS2Q96Q42 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ALS2Q96Q42 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ALS2Q96Q42 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ALS2Q96Q42 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ALS2Q96Q42 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ALS2Q96Q42 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ALS2Q96Q42 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
ALS2Q96Q42 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ALS2Q96Q42 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ALS2Q96Q42 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ALS2Q96Q42 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ALS2Q96Q42 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ALS2Q96Q42 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ALS2Q96Q42 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ALS2Q96Q42 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ALS2Q96Q42 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ALS2Q96Q42 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
ALS2Q96Q42 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ALS2Q96Q42 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ALS2Q96Q42 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ALS2Q96Q42 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ALS2Q96Q42 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ALS2Q96Q42 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ALS2Q96Q42 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ALS2Q96Q42 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ALS2Q96Q42 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ALS2Q96Q42 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ALS2Q96Q42 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ALS2Q96Q42 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ALS2Q96Q42 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ALS2Q96Q42 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ALS2Q96Q42 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ALS2Q96Q42 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ALS2Q96Q42 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ALS2Q96Q42 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ALS2Q96Q42 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ALS2Q96Q42 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ALS2Q96Q42 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ALS2Q96Q42 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ALS2Q96Q42 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ALS2Q96Q42 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ALS2Q96Q42 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ALS2Q96Q42 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ALS2Q96Q42 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ALS2Q96Q42 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
ALS2Q96Q42 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ALS2Q96Q42 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ALS2Q96Q42 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ALS2Q96Q42 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ALS2Q96Q42 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ALS2Q96Q42 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ALS2Q96Q42 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
ALS2Q96Q42 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ALS2Q96Q42 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ALS2Q96Q42 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ALS2Q96Q42 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ALS2Q96Q42 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ALS2Q96Q42 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ALS2Q96Q42 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ALS2Q96Q42 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ALS2Q96Q42 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ALS2Q96Q42 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ALS2Q96Q42 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ALS2Q96Q42 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ALS2Q96Q42 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ALS2Q96Q42 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ALS2Q96Q42 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms