Protein–RNA interactions for Protein: Q96NK8

NEUROD6, Neurogenic differentiation factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD6Q96NK8 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEUROD6Q96NK8 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEUROD6Q96NK8 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEUROD6Q96NK8 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEUROD6Q96NK8 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEUROD6Q96NK8 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEUROD6Q96NK8 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEUROD6Q96NK8 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEUROD6Q96NK8 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEUROD6Q96NK8 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEUROD6Q96NK8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEUROD6Q96NK8 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEUROD6Q96NK8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEUROD6Q96NK8 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NEUROD6Q96NK8 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEUROD6Q96NK8 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEUROD6Q96NK8 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEUROD6Q96NK8 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NEUROD6Q96NK8 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEUROD6Q96NK8 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEUROD6Q96NK8 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEUROD6Q96NK8 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEUROD6Q96NK8 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEUROD6Q96NK8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEUROD6Q96NK8 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEUROD6Q96NK8 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEUROD6Q96NK8 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEUROD6Q96NK8 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEUROD6Q96NK8 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NEUROD6Q96NK8 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEUROD6Q96NK8 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEUROD6Q96NK8 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEUROD6Q96NK8 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NEUROD6Q96NK8 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEUROD6Q96NK8 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEUROD6Q96NK8 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEUROD6Q96NK8 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEUROD6Q96NK8 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEUROD6Q96NK8 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEUROD6Q96NK8 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEUROD6Q96NK8 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEUROD6Q96NK8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEUROD6Q96NK8 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEUROD6Q96NK8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEUROD6Q96NK8 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEUROD6Q96NK8 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEUROD6Q96NK8 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEUROD6Q96NK8 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEUROD6Q96NK8 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NEUROD6Q96NK8 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEUROD6Q96NK8 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEUROD6Q96NK8 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEUROD6Q96NK8 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEUROD6Q96NK8 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEUROD6Q96NK8 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEUROD6Q96NK8 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEUROD6Q96NK8 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEUROD6Q96NK8 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEUROD6Q96NK8 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEUROD6Q96NK8 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEUROD6Q96NK8 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEUROD6Q96NK8 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NEUROD6Q96NK8 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEUROD6Q96NK8 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEUROD6Q96NK8 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEUROD6Q96NK8 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEUROD6Q96NK8 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEUROD6Q96NK8 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEUROD6Q96NK8 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEUROD6Q96NK8 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEUROD6Q96NK8 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEUROD6Q96NK8 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEUROD6Q96NK8 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEUROD6Q96NK8 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEUROD6Q96NK8 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEUROD6Q96NK8 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEUROD6Q96NK8 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEUROD6Q96NK8 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEUROD6Q96NK8 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEUROD6Q96NK8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEUROD6Q96NK8 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEUROD6Q96NK8 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEUROD6Q96NK8 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEUROD6Q96NK8 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEUROD6Q96NK8 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEUROD6Q96NK8 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NEUROD6Q96NK8 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEUROD6Q96NK8 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEUROD6Q96NK8 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEUROD6Q96NK8 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEUROD6Q96NK8 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEUROD6Q96NK8 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEUROD6Q96NK8 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NEUROD6Q96NK8 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEUROD6Q96NK8 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEUROD6Q96NK8 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEUROD6Q96NK8 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NEUROD6Q96NK8 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NEUROD6Q96NK8 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEUROD6Q96NK8 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms