Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C9orf85Q96MD7 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C9orf85Q96MD7 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C9orf85Q96MD7 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C9orf85Q96MD7 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C9orf85Q96MD7 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C9orf85Q96MD7 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C9orf85Q96MD7 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C9orf85Q96MD7 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C9orf85Q96MD7 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C9orf85Q96MD7 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf85Q96MD7 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf85Q96MD7 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf85Q96MD7 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf85Q96MD7 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf85Q96MD7 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf85Q96MD7 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf85Q96MD7 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf85Q96MD7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf85Q96MD7 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf85Q96MD7 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf85Q96MD7 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf85Q96MD7 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf85Q96MD7 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf85Q96MD7 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf85Q96MD7 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf85Q96MD7 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf85Q96MD7 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf85Q96MD7 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C9orf85Q96MD7 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
C9orf85Q96MD7 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C9orf85Q96MD7 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C9orf85Q96MD7 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C9orf85Q96MD7 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C9orf85Q96MD7 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C9orf85Q96MD7 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C9orf85Q96MD7 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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C9orf85Q96MD7 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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C9orf85Q96MD7 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C9orf85Q96MD7 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C9orf85Q96MD7 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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C9orf85Q96MD7 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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C9orf85Q96MD7 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf85Q96MD7 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf85Q96MD7 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf85Q96MD7 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
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C9orf85Q96MD7 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf85Q96MD7 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf85Q96MD7 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf85Q96MD7 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf85Q96MD7 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf85Q96MD7 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf85Q96MD7 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf85Q96MD7 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf85Q96MD7 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf85Q96MD7 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf85Q96MD7 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf85Q96MD7 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf85Q96MD7 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf85Q96MD7 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf85Q96MD7 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf85Q96MD7 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf85Q96MD7 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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