Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD8

SENP8, Sentrin-specific protease 8, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP8Q96LD8 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SENP8Q96LD8 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SENP8Q96LD8 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SENP8Q96LD8 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SENP8Q96LD8 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SENP8Q96LD8 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SENP8Q96LD8 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SENP8Q96LD8 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SENP8Q96LD8 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SENP8Q96LD8 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SENP8Q96LD8 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SENP8Q96LD8 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SENP8Q96LD8 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SENP8Q96LD8 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SENP8Q96LD8 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SENP8Q96LD8 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SENP8Q96LD8 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SENP8Q96LD8 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SENP8Q96LD8 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SENP8Q96LD8 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SENP8Q96LD8 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SENP8Q96LD8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SENP8Q96LD8 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SENP8Q96LD8 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SENP8Q96LD8 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SENP8Q96LD8 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SENP8Q96LD8 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SENP8Q96LD8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SENP8Q96LD8 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SENP8Q96LD8 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SENP8Q96LD8 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SENP8Q96LD8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SENP8Q96LD8 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SENP8Q96LD8 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SENP8Q96LD8 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SENP8Q96LD8 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SENP8Q96LD8 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SENP8Q96LD8 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SENP8Q96LD8 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SENP8Q96LD8 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SENP8Q96LD8 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SENP8Q96LD8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SENP8Q96LD8 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SENP8Q96LD8 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SENP8Q96LD8 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SENP8Q96LD8 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SENP8Q96LD8 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SENP8Q96LD8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SENP8Q96LD8 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SENP8Q96LD8 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SENP8Q96LD8 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SENP8Q96LD8 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SENP8Q96LD8 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SENP8Q96LD8 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SENP8Q96LD8 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SENP8Q96LD8 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SENP8Q96LD8 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SENP8Q96LD8 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SENP8Q96LD8 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SENP8Q96LD8 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SENP8Q96LD8 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SENP8Q96LD8 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SENP8Q96LD8 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SENP8Q96LD8 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SENP8Q96LD8 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SENP8Q96LD8 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SENP8Q96LD8 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SENP8Q96LD8 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SENP8Q96LD8 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SENP8Q96LD8 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SENP8Q96LD8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SENP8Q96LD8 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SENP8Q96LD8 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SENP8Q96LD8 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SENP8Q96LD8 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SENP8Q96LD8 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SENP8Q96LD8 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SENP8Q96LD8 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SENP8Q96LD8 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SENP8Q96LD8 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SENP8Q96LD8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SENP8Q96LD8 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SENP8Q96LD8 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SENP8Q96LD8 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SENP8Q96LD8 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SENP8Q96LD8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SENP8Q96LD8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SENP8Q96LD8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SENP8Q96LD8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SENP8Q96LD8 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SENP8Q96LD8 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SENP8Q96LD8 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SENP8Q96LD8 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SENP8Q96LD8 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SENP8Q96LD8 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SENP8Q96LD8 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SENP8Q96LD8 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SENP8Q96LD8 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SENP8Q96LD8 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SENP8Q96LD8 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms