Protein–RNA interactions for Protein: Q96L14

CEP170P1, Cep170-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170P1Q96L14 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CEP170P1Q96L14 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CEP170P1Q96L14 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CEP170P1Q96L14 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CEP170P1Q96L14 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CEP170P1Q96L14 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CEP170P1Q96L14 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CEP170P1Q96L14 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CEP170P1Q96L14 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CEP170P1Q96L14 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CEP170P1Q96L14 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CEP170P1Q96L14 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CEP170P1Q96L14 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CEP170P1Q96L14 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CEP170P1Q96L14 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CEP170P1Q96L14 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CEP170P1Q96L14 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CEP170P1Q96L14 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CEP170P1Q96L14 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CEP170P1Q96L14 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CEP170P1Q96L14 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CEP170P1Q96L14 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CEP170P1Q96L14 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CEP170P1Q96L14 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CEP170P1Q96L14 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CEP170P1Q96L14 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CEP170P1Q96L14 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CEP170P1Q96L14 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CEP170P1Q96L14 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CEP170P1Q96L14 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CEP170P1Q96L14 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CEP170P1Q96L14 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CEP170P1Q96L14 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CEP170P1Q96L14 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CEP170P1Q96L14 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CEP170P1Q96L14 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CEP170P1Q96L14 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CEP170P1Q96L14 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CEP170P1Q96L14 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CEP170P1Q96L14 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CEP170P1Q96L14 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CEP170P1Q96L14 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CEP170P1Q96L14 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CEP170P1Q96L14 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CEP170P1Q96L14 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CEP170P1Q96L14 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CEP170P1Q96L14 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CEP170P1Q96L14 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CEP170P1Q96L14 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CEP170P1Q96L14 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CEP170P1Q96L14 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CEP170P1Q96L14 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CEP170P1Q96L14 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CEP170P1Q96L14 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CEP170P1Q96L14 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CEP170P1Q96L14 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CEP170P1Q96L14 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CEP170P1Q96L14 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CEP170P1Q96L14 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CEP170P1Q96L14 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CEP170P1Q96L14 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CEP170P1Q96L14 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CEP170P1Q96L14 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CEP170P1Q96L14 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CEP170P1Q96L14 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CEP170P1Q96L14 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CEP170P1Q96L14 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CEP170P1Q96L14 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CEP170P1Q96L14 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CEP170P1Q96L14 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CEP170P1Q96L14 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CEP170P1Q96L14 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CEP170P1Q96L14 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CEP170P1Q96L14 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CEP170P1Q96L14 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CEP170P1Q96L14 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CEP170P1Q96L14 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CEP170P1Q96L14 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CEP170P1Q96L14 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CEP170P1Q96L14 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CEP170P1Q96L14 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CEP170P1Q96L14 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CEP170P1Q96L14 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CEP170P1Q96L14 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CEP170P1Q96L14 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CEP170P1Q96L14 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CEP170P1Q96L14 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CEP170P1Q96L14 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CEP170P1Q96L14 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CEP170P1Q96L14 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CEP170P1Q96L14 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CEP170P1Q96L14 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CEP170P1Q96L14 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CEP170P1Q96L14 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CEP170P1Q96L14 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CEP170P1Q96L14 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CEP170P1Q96L14 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CEP170P1Q96L14 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CEP170P1Q96L14 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CEP170P1Q96L14 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms