Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ5

MS4A3, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A3Q96HJ5 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 ZNF736P11Y-201ENST00000442535 1213 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 ZNF736P12Y-201ENST00000443152 1243 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 AL160408.1-203ENST00000453568 631 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 ZNF736P4Y-201ENST00000454995 1243 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 AL355306.2-209ENST00000437803 357 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 RN7SL371P-201ENST00000578099 267 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 SEPT7P7-201ENST00000420492 1301 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 RPL12P24-201ENST00000474907 486 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 TMF1P1-201ENST00000576058 373 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 ACTG1P22-201ENST00000603793 1099 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms