Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC34Q96HJ3 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC34Q96HJ3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC34Q96HJ3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC34Q96HJ3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC34Q96HJ3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC34Q96HJ3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC34Q96HJ3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC34Q96HJ3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC34Q96HJ3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC34Q96HJ3 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC34Q96HJ3 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC34Q96HJ3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC34Q96HJ3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC34Q96HJ3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC34Q96HJ3 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC34Q96HJ3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC34Q96HJ3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC34Q96HJ3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC34Q96HJ3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC34Q96HJ3 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC34Q96HJ3 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC34Q96HJ3 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC34Q96HJ3 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC34Q96HJ3 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC34Q96HJ3 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC34Q96HJ3 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC34Q96HJ3 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC34Q96HJ3 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC34Q96HJ3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC34Q96HJ3 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC34Q96HJ3 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC34Q96HJ3 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC34Q96HJ3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC34Q96HJ3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC34Q96HJ3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC34Q96HJ3 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC34Q96HJ3 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC34Q96HJ3 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC34Q96HJ3 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC34Q96HJ3 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC34Q96HJ3 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC34Q96HJ3 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC34Q96HJ3 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC34Q96HJ3 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC34Q96HJ3 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC34Q96HJ3 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC34Q96HJ3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC34Q96HJ3 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC34Q96HJ3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC34Q96HJ3 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC34Q96HJ3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC34Q96HJ3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC34Q96HJ3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC34Q96HJ3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC34Q96HJ3 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC34Q96HJ3 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC34Q96HJ3 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC34Q96HJ3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC34Q96HJ3 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC34Q96HJ3 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC34Q96HJ3 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC34Q96HJ3 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC34Q96HJ3 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC34Q96HJ3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC34Q96HJ3 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC34Q96HJ3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC34Q96HJ3 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC34Q96HJ3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC34Q96HJ3 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC34Q96HJ3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC34Q96HJ3 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC34Q96HJ3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC34Q96HJ3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC34Q96HJ3 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC34Q96HJ3 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC34Q96HJ3 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC34Q96HJ3 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC34Q96HJ3 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC34Q96HJ3 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC34Q96HJ3 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC34Q96HJ3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC34Q96HJ3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC34Q96HJ3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC34Q96HJ3 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC34Q96HJ3 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC34Q96HJ3 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC34Q96HJ3 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC34Q96HJ3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC34Q96HJ3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
CCDC34Q96HJ3 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
CCDC34Q96HJ3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC34Q96HJ3 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC34Q96HJ3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC34Q96HJ3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC34Q96HJ3 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC34Q96HJ3 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC34Q96HJ3 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC34Q96HJ3 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC34Q96HJ3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms