Protein–RNA interactions for Protein: Q96EF6

FBXO17, F-box only protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO17Q96EF6 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXO17Q96EF6 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXO17Q96EF6 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXO17Q96EF6 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXO17Q96EF6 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXO17Q96EF6 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXO17Q96EF6 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXO17Q96EF6 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXO17Q96EF6 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXO17Q96EF6 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXO17Q96EF6 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXO17Q96EF6 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXO17Q96EF6 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXO17Q96EF6 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXO17Q96EF6 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXO17Q96EF6 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXO17Q96EF6 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXO17Q96EF6 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXO17Q96EF6 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXO17Q96EF6 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXO17Q96EF6 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXO17Q96EF6 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXO17Q96EF6 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXO17Q96EF6 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXO17Q96EF6 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXO17Q96EF6 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXO17Q96EF6 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXO17Q96EF6 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXO17Q96EF6 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXO17Q96EF6 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXO17Q96EF6 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXO17Q96EF6 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXO17Q96EF6 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FBXO17Q96EF6 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FBXO17Q96EF6 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FBXO17Q96EF6 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FBXO17Q96EF6 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FBXO17Q96EF6 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FBXO17Q96EF6 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FBXO17Q96EF6 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FBXO17Q96EF6 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FBXO17Q96EF6 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FBXO17Q96EF6 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FBXO17Q96EF6 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FBXO17Q96EF6 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FBXO17Q96EF6 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FBXO17Q96EF6 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FBXO17Q96EF6 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FBXO17Q96EF6 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FBXO17Q96EF6 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FBXO17Q96EF6 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FBXO17Q96EF6 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FBXO17Q96EF6 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FBXO17Q96EF6 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FBXO17Q96EF6 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FBXO17Q96EF6 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FBXO17Q96EF6 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FBXO17Q96EF6 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FBXO17Q96EF6 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FBXO17Q96EF6 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FBXO17Q96EF6 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FBXO17Q96EF6 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FBXO17Q96EF6 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
FBXO17Q96EF6 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
FBXO17Q96EF6 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
FBXO17Q96EF6 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FBXO17Q96EF6 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FBXO17Q96EF6 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FBXO17Q96EF6 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FBXO17Q96EF6 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FBXO17Q96EF6 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
FBXO17Q96EF6 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FBXO17Q96EF6 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FBXO17Q96EF6 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FBXO17Q96EF6 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FBXO17Q96EF6 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FBXO17Q96EF6 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FBXO17Q96EF6 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FBXO17Q96EF6 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
FBXO17Q96EF6 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FBXO17Q96EF6 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FBXO17Q96EF6 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FBXO17Q96EF6 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
FBXO17Q96EF6 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FBXO17Q96EF6 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FBXO17Q96EF6 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FBXO17Q96EF6 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FBXO17Q96EF6 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
FBXO17Q96EF6 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
FBXO17Q96EF6 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FBXO17Q96EF6 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FBXO17Q96EF6 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FBXO17Q96EF6 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FBXO17Q96EF6 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FBXO17Q96EF6 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FBXO17Q96EF6 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FBXO17Q96EF6 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FBXO17Q96EF6 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FBXO17Q96EF6 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FBXO17Q96EF6 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms