Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM1

PGBD4, PiggyBac transposable element-derived protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD4Q96DM1 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PGBD4Q96DM1 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PGBD4Q96DM1 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PGBD4Q96DM1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PGBD4Q96DM1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PGBD4Q96DM1 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PGBD4Q96DM1 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PGBD4Q96DM1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PGBD4Q96DM1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PGBD4Q96DM1 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGBD4Q96DM1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGBD4Q96DM1 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGBD4Q96DM1 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGBD4Q96DM1 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGBD4Q96DM1 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGBD4Q96DM1 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGBD4Q96DM1 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGBD4Q96DM1 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGBD4Q96DM1 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGBD4Q96DM1 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGBD4Q96DM1 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGBD4Q96DM1 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PGBD4Q96DM1 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PGBD4Q96DM1 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGBD4Q96DM1 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGBD4Q96DM1 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGBD4Q96DM1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGBD4Q96DM1 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGBD4Q96DM1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGBD4Q96DM1 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGBD4Q96DM1 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGBD4Q96DM1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGBD4Q96DM1 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PGBD4Q96DM1 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PGBD4Q96DM1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PGBD4Q96DM1 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PGBD4Q96DM1 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PGBD4Q96DM1 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PGBD4Q96DM1 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PGBD4Q96DM1 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PGBD4Q96DM1 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PGBD4Q96DM1 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PGBD4Q96DM1 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PGBD4Q96DM1 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PGBD4Q96DM1 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PGBD4Q96DM1 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PGBD4Q96DM1 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PGBD4Q96DM1 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PGBD4Q96DM1 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PGBD4Q96DM1 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PGBD4Q96DM1 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PGBD4Q96DM1 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PGBD4Q96DM1 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PGBD4Q96DM1 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PGBD4Q96DM1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PGBD4Q96DM1 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PGBD4Q96DM1 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PGBD4Q96DM1 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PGBD4Q96DM1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PGBD4Q96DM1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PGBD4Q96DM1 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PGBD4Q96DM1 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PGBD4Q96DM1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PGBD4Q96DM1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PGBD4Q96DM1 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PGBD4Q96DM1 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PGBD4Q96DM1 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PGBD4Q96DM1 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PGBD4Q96DM1 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PGBD4Q96DM1 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PGBD4Q96DM1 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PGBD4Q96DM1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PGBD4Q96DM1 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PGBD4Q96DM1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PGBD4Q96DM1 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PGBD4Q96DM1 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PGBD4Q96DM1 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PGBD4Q96DM1 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PGBD4Q96DM1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PGBD4Q96DM1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PGBD4Q96DM1 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PGBD4Q96DM1 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PGBD4Q96DM1 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PGBD4Q96DM1 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PGBD4Q96DM1 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PGBD4Q96DM1 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PGBD4Q96DM1 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PGBD4Q96DM1 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PGBD4Q96DM1 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PGBD4Q96DM1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PGBD4Q96DM1 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PGBD4Q96DM1 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PGBD4Q96DM1 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PGBD4Q96DM1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PGBD4Q96DM1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PGBD4Q96DM1 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PGBD4Q96DM1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PGBD4Q96DM1 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PGBD4Q96DM1 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PGBD4Q96DM1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms