Protein–RNA interactions for Protein: Q96A19

CCDC102A, Coiled-coil domain-containing protein 102A, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC102AQ96A19 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC102AQ96A19 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC102AQ96A19 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC102AQ96A19 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC102AQ96A19 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC102AQ96A19 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC102AQ96A19 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC102AQ96A19 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC102AQ96A19 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC102AQ96A19 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC102AQ96A19 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC102AQ96A19 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC102AQ96A19 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC102AQ96A19 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC102AQ96A19 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC102AQ96A19 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC102AQ96A19 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC102AQ96A19 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC102AQ96A19 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC102AQ96A19 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC102AQ96A19 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC102AQ96A19 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC102AQ96A19 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC102AQ96A19 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC102AQ96A19 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC102AQ96A19 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC102AQ96A19 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC102AQ96A19 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC102AQ96A19 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC102AQ96A19 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC102AQ96A19 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC102AQ96A19 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC102AQ96A19 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC102AQ96A19 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC102AQ96A19 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC102AQ96A19 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC102AQ96A19 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC102AQ96A19 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC102AQ96A19 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC102AQ96A19 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC102AQ96A19 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC102AQ96A19 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC102AQ96A19 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC102AQ96A19 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC102AQ96A19 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC102AQ96A19 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC102AQ96A19 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC102AQ96A19 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC102AQ96A19 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC102AQ96A19 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC102AQ96A19 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC102AQ96A19 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC102AQ96A19 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC102AQ96A19 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC102AQ96A19 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC102AQ96A19 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC102AQ96A19 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC102AQ96A19 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC102AQ96A19 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC102AQ96A19 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC102AQ96A19 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC102AQ96A19 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC102AQ96A19 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC102AQ96A19 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC102AQ96A19 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC102AQ96A19 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC102AQ96A19 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC102AQ96A19 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC102AQ96A19 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC102AQ96A19 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC102AQ96A19 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC102AQ96A19 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC102AQ96A19 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC102AQ96A19 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC102AQ96A19 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC102AQ96A19 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC102AQ96A19 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC102AQ96A19 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC102AQ96A19 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC102AQ96A19 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC102AQ96A19 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC102AQ96A19 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC102AQ96A19 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC102AQ96A19 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC102AQ96A19 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC102AQ96A19 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC102AQ96A19 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC102AQ96A19 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC102AQ96A19 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC102AQ96A19 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC102AQ96A19 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC102AQ96A19 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC102AQ96A19 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC102AQ96A19 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC102AQ96A19 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC102AQ96A19 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC102AQ96A19 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC102AQ96A19 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC102AQ96A19 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC102AQ96A19 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms