Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

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Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM63Q969Q1 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM63Q969Q1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM63Q969Q1 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM63Q969Q1 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM63Q969Q1 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM63Q969Q1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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