Protein–RNA interactions for Protein: Q92878

RAD50, DNA repair protein RAD50, humanhuman

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD50Q92878 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RAD50Q92878 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAD50Q92878 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAD50Q92878 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAD50Q92878 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAD50Q92878 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAD50Q92878 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAD50Q92878 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAD50Q92878 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAD50Q92878 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
RAD50Q92878 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
RAD50Q92878 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.56
RAD50Q92878 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RAD50Q92878 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
RAD50Q92878 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAD50Q92878 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RAD50Q92878 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAD50Q92878 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RAD50Q92878 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAD50Q92878 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RAD50Q92878 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAD50Q92878 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAD50Q92878 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAD50Q92878 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAD50Q92878 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAD50Q92878 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAD50Q92878 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAD50Q92878 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAD50Q92878 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAD50Q92878 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAD50Q92878 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAD50Q92878 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAD50Q92878 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAD50Q92878 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAD50Q92878 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAD50Q92878 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAD50Q92878 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAD50Q92878 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAD50Q92878 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAD50Q92878 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAD50Q92878 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAD50Q92878 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAD50Q92878 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAD50Q92878 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAD50Q92878 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAD50Q92878 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAD50Q92878 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAD50Q92878 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RAD50Q92878 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAD50Q92878 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAD50Q92878 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAD50Q92878 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAD50Q92878 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAD50Q92878 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAD50Q92878 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RAD50Q92878 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAD50Q92878 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAD50Q92878 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAD50Q92878 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAD50Q92878 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAD50Q92878 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RAD50Q92878 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RAD50Q92878 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAD50Q92878 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAD50Q92878 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAD50Q92878 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAD50Q92878 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAD50Q92878 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAD50Q92878 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAD50Q92878 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAD50Q92878 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAD50Q92878 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAD50Q92878 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAD50Q92878 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAD50Q92878 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RAD50Q92878 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RAD50Q92878 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RAD50Q92878 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAD50Q92878 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAD50Q92878 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAD50Q92878 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAD50Q92878 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAD50Q92878 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAD50Q92878 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAD50Q92878 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAD50Q92878 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAD50Q92878 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAD50Q92878 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAD50Q92878 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAD50Q92878 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAD50Q92878 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RAD50Q92878 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAD50Q92878 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RAD50Q92878 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAD50Q92878 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAD50Q92878 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAD50Q92878 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAD50Q92878 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAD50Q92878 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAD50Q92878 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms