Protein–RNA interactions for Protein: Q92854

SEMA4D, Semaphorin-4D, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4DQ92854 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA4DQ92854 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA4DQ92854 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA4DQ92854 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA4DQ92854 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA4DQ92854 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA4DQ92854 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA4DQ92854 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA4DQ92854 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA4DQ92854 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA4DQ92854 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA4DQ92854 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA4DQ92854 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA4DQ92854 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA4DQ92854 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA4DQ92854 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA4DQ92854 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA4DQ92854 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA4DQ92854 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA4DQ92854 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA4DQ92854 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA4DQ92854 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA4DQ92854 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA4DQ92854 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA4DQ92854 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA4DQ92854 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA4DQ92854 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA4DQ92854 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA4DQ92854 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA4DQ92854 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA4DQ92854 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SEMA4DQ92854 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SEMA4DQ92854 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SEMA4DQ92854 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SEMA4DQ92854 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SEMA4DQ92854 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA4DQ92854 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA4DQ92854 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA4DQ92854 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA4DQ92854 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA4DQ92854 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA4DQ92854 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA4DQ92854 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA4DQ92854 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA4DQ92854 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA4DQ92854 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA4DQ92854 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA4DQ92854 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA4DQ92854 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA4DQ92854 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA4DQ92854 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA4DQ92854 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA4DQ92854 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA4DQ92854 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA4DQ92854 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA4DQ92854 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA4DQ92854 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA4DQ92854 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA4DQ92854 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA4DQ92854 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA4DQ92854 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA4DQ92854 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA4DQ92854 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA4DQ92854 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA4DQ92854 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA4DQ92854 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA4DQ92854 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA4DQ92854 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA4DQ92854 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA4DQ92854 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA4DQ92854 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA4DQ92854 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA4DQ92854 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA4DQ92854 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA4DQ92854 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA4DQ92854 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA4DQ92854 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA4DQ92854 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA4DQ92854 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA4DQ92854 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA4DQ92854 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA4DQ92854 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA4DQ92854 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA4DQ92854 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA4DQ92854 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA4DQ92854 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA4DQ92854 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA4DQ92854 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA4DQ92854 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA4DQ92854 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA4DQ92854 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA4DQ92854 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA4DQ92854 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA4DQ92854 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA4DQ92854 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA4DQ92854 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA4DQ92854 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA4DQ92854 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA4DQ92854 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA4DQ92854 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms