Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPRUQ92729 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPRUQ92729 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPRUQ92729 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPRUQ92729 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPRUQ92729 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPRUQ92729 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPRUQ92729 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTPRUQ92729 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTPRUQ92729 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTPRUQ92729 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTPRUQ92729 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTPRUQ92729 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTPRUQ92729 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTPRUQ92729 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
PTPRUQ92729 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTPRUQ92729 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
PTPRUQ92729 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTPRUQ92729 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTPRUQ92729 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTPRUQ92729 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTPRUQ92729 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTPRUQ92729 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTPRUQ92729 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTPRUQ92729 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTPRUQ92729 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTPRUQ92729 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.24
PTPRUQ92729 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTPRUQ92729 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTPRUQ92729 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTPRUQ92729 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTPRUQ92729 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTPRUQ92729 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTPRUQ92729 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTPRUQ92729 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTPRUQ92729 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
PTPRUQ92729 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTPRUQ92729 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTPRUQ92729 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTPRUQ92729 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTPRUQ92729 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTPRUQ92729 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTPRUQ92729 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
PTPRUQ92729 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTPRUQ92729 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTPRUQ92729 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTPRUQ92729 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTPRUQ92729 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PTPRUQ92729 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PTPRUQ92729 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PTPRUQ92729 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
PTPRUQ92729 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PTPRUQ92729 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PTPRUQ92729 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PTPRUQ92729 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PTPRUQ92729 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PTPRUQ92729 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PTPRUQ92729 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PTPRUQ92729 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PTPRUQ92729 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PTPRUQ92729 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PTPRUQ92729 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PTPRUQ92729 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PTPRUQ92729 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PTPRUQ92729 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PTPRUQ92729 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
PTPRUQ92729 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PTPRUQ92729 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PTPRUQ92729 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PTPRUQ92729 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
PTPRUQ92729 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PTPRUQ92729 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PTPRUQ92729 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
PTPRUQ92729 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PTPRUQ92729 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PTPRUQ92729 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PTPRUQ92729 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PTPRUQ92729 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PTPRUQ92729 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PTPRUQ92729 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PTPRUQ92729 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PTPRUQ92729 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PTPRUQ92729 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PTPRUQ92729 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PTPRUQ92729 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
PTPRUQ92729 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PTPRUQ92729 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PTPRUQ92729 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PTPRUQ92729 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PTPRUQ92729 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PTPRUQ92729 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PTPRUQ92729 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PTPRUQ92729 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
PTPRUQ92729 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PTPRUQ92729 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.24
PTPRUQ92729 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PTPRUQ92729 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PTPRUQ92729 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PTPRUQ92729 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PTPRUQ92729 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms