Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDG4

HELQ, Helicase POLQ-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELQQ8TDG4 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HELQQ8TDG4 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HELQQ8TDG4 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HELQQ8TDG4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HELQQ8TDG4 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HELQQ8TDG4 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HELQQ8TDG4 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HELQQ8TDG4 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HELQQ8TDG4 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HELQQ8TDG4 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HELQQ8TDG4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HELQQ8TDG4 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HELQQ8TDG4 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HELQQ8TDG4 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HELQQ8TDG4 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HELQQ8TDG4 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HELQQ8TDG4 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HELQQ8TDG4 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HELQQ8TDG4 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HELQQ8TDG4 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HELQQ8TDG4 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HELQQ8TDG4 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HELQQ8TDG4 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HELQQ8TDG4 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HELQQ8TDG4 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HELQQ8TDG4 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HELQQ8TDG4 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HELQQ8TDG4 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HELQQ8TDG4 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HELQQ8TDG4 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HELQQ8TDG4 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HELQQ8TDG4 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HELQQ8TDG4 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HELQQ8TDG4 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HELQQ8TDG4 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HELQQ8TDG4 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HELQQ8TDG4 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HELQQ8TDG4 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HELQQ8TDG4 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HELQQ8TDG4 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HELQQ8TDG4 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HELQQ8TDG4 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HELQQ8TDG4 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HELQQ8TDG4 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HELQQ8TDG4 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HELQQ8TDG4 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HELQQ8TDG4 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HELQQ8TDG4 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HELQQ8TDG4 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HELQQ8TDG4 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HELQQ8TDG4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HELQQ8TDG4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HELQQ8TDG4 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HELQQ8TDG4 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HELQQ8TDG4 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HELQQ8TDG4 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HELQQ8TDG4 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HELQQ8TDG4 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HELQQ8TDG4 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HELQQ8TDG4 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HELQQ8TDG4 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HELQQ8TDG4 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HELQQ8TDG4 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HELQQ8TDG4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HELQQ8TDG4 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HELQQ8TDG4 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HELQQ8TDG4 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HELQQ8TDG4 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HELQQ8TDG4 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HELQQ8TDG4 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HELQQ8TDG4 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HELQQ8TDG4 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HELQQ8TDG4 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HELQQ8TDG4 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HELQQ8TDG4 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HELQQ8TDG4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HELQQ8TDG4 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HELQQ8TDG4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HELQQ8TDG4 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HELQQ8TDG4 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HELQQ8TDG4 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HELQQ8TDG4 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HELQQ8TDG4 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HELQQ8TDG4 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HELQQ8TDG4 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HELQQ8TDG4 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HELQQ8TDG4 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HELQQ8TDG4 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HELQQ8TDG4 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
HELQQ8TDG4 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HELQQ8TDG4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HELQQ8TDG4 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HELQQ8TDG4 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HELQQ8TDG4 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HELQQ8TDG4 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HELQQ8TDG4 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HELQQ8TDG4 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HELQQ8TDG4 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HELQQ8TDG4 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HELQQ8TDG4 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms