Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE01

CNNM3, Metal transporter CNNM3, humanhuman

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM3Q8NE01 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNNM3Q8NE01 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNNM3Q8NE01 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNNM3Q8NE01 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNNM3Q8NE01 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNNM3Q8NE01 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNNM3Q8NE01 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNNM3Q8NE01 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNNM3Q8NE01 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNNM3Q8NE01 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNNM3Q8NE01 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CNNM3Q8NE01 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CNNM3Q8NE01 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNNM3Q8NE01 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNNM3Q8NE01 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNNM3Q8NE01 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNNM3Q8NE01 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNNM3Q8NE01 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNNM3Q8NE01 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNNM3Q8NE01 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNNM3Q8NE01 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNNM3Q8NE01 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNNM3Q8NE01 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNNM3Q8NE01 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNNM3Q8NE01 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNNM3Q8NE01 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNNM3Q8NE01 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CNNM3Q8NE01 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CNNM3Q8NE01 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CNNM3Q8NE01 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CNNM3Q8NE01 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CNNM3Q8NE01 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CNNM3Q8NE01 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CNNM3Q8NE01 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNNM3Q8NE01 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNNM3Q8NE01 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNNM3Q8NE01 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNNM3Q8NE01 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNNM3Q8NE01 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNNM3Q8NE01 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNNM3Q8NE01 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNNM3Q8NE01 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNNM3Q8NE01 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNNM3Q8NE01 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNNM3Q8NE01 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNNM3Q8NE01 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNNM3Q8NE01 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNNM3Q8NE01 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNNM3Q8NE01 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNNM3Q8NE01 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNNM3Q8NE01 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNNM3Q8NE01 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNNM3Q8NE01 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNNM3Q8NE01 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNNM3Q8NE01 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNNM3Q8NE01 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNNM3Q8NE01 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNNM3Q8NE01 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CNNM3Q8NE01 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNNM3Q8NE01 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNNM3Q8NE01 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNNM3Q8NE01 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNNM3Q8NE01 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNNM3Q8NE01 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNNM3Q8NE01 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNNM3Q8NE01 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNNM3Q8NE01 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNNM3Q8NE01 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNNM3Q8NE01 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CNNM3Q8NE01 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNNM3Q8NE01 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNNM3Q8NE01 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNNM3Q8NE01 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNNM3Q8NE01 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNNM3Q8NE01 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNNM3Q8NE01 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNNM3Q8NE01 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNNM3Q8NE01 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNNM3Q8NE01 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNNM3Q8NE01 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNNM3Q8NE01 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNNM3Q8NE01 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNNM3Q8NE01 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNNM3Q8NE01 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNNM3Q8NE01 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNNM3Q8NE01 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CNNM3Q8NE01 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNNM3Q8NE01 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNNM3Q8NE01 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CNNM3Q8NE01 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CNNM3Q8NE01 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNNM3Q8NE01 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNNM3Q8NE01 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNNM3Q8NE01 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNNM3Q8NE01 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNNM3Q8NE01 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNNM3Q8NE01 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNNM3Q8NE01 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNNM3Q8NE01 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNNM3Q8NE01 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms