Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB14

USP38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP38Q8NB14 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
USP38Q8NB14 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
USP38Q8NB14 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP38Q8NB14 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP38Q8NB14 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP38Q8NB14 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP38Q8NB14 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP38Q8NB14 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
USP38Q8NB14 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP38Q8NB14 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP38Q8NB14 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP38Q8NB14 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP38Q8NB14 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP38Q8NB14 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP38Q8NB14 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP38Q8NB14 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP38Q8NB14 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP38Q8NB14 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP38Q8NB14 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP38Q8NB14 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
USP38Q8NB14 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP38Q8NB14 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP38Q8NB14 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP38Q8NB14 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP38Q8NB14 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP38Q8NB14 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
USP38Q8NB14 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP38Q8NB14 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP38Q8NB14 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP38Q8NB14 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP38Q8NB14 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP38Q8NB14 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP38Q8NB14 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP38Q8NB14 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP38Q8NB14 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP38Q8NB14 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP38Q8NB14 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP38Q8NB14 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP38Q8NB14 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP38Q8NB14 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
USP38Q8NB14 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP38Q8NB14 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP38Q8NB14 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP38Q8NB14 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP38Q8NB14 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
USP38Q8NB14 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP38Q8NB14 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP38Q8NB14 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
USP38Q8NB14 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP38Q8NB14 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
USP38Q8NB14 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP38Q8NB14 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP38Q8NB14 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
USP38Q8NB14 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
USP38Q8NB14 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP38Q8NB14 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP38Q8NB14 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
USP38Q8NB14 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP38Q8NB14 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP38Q8NB14 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
USP38Q8NB14 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
USP38Q8NB14 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP38Q8NB14 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP38Q8NB14 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP38Q8NB14 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP38Q8NB14 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP38Q8NB14 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP38Q8NB14 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP38Q8NB14 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP38Q8NB14 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP38Q8NB14 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP38Q8NB14 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP38Q8NB14 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP38Q8NB14 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP38Q8NB14 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP38Q8NB14 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP38Q8NB14 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
USP38Q8NB14 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
USP38Q8NB14 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP38Q8NB14 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP38Q8NB14 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP38Q8NB14 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP38Q8NB14 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP38Q8NB14 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP38Q8NB14 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP38Q8NB14 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP38Q8NB14 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP38Q8NB14 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP38Q8NB14 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP38Q8NB14 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP38Q8NB14 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP38Q8NB14 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP38Q8NB14 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP38Q8NB14 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP38Q8NB14 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP38Q8NB14 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP38Q8NB14 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP38Q8NB14 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP38Q8NB14 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP38Q8NB14 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms