Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA47

CCDC63, Coiled-coil domain-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC63Q8NA47 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC63Q8NA47 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC63Q8NA47 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC63Q8NA47 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC63Q8NA47 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC63Q8NA47 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC63Q8NA47 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC63Q8NA47 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC63Q8NA47 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC63Q8NA47 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC63Q8NA47 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC63Q8NA47 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC63Q8NA47 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC63Q8NA47 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC63Q8NA47 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC63Q8NA47 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC63Q8NA47 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC63Q8NA47 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC63Q8NA47 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC63Q8NA47 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC63Q8NA47 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC63Q8NA47 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC63Q8NA47 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC63Q8NA47 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC63Q8NA47 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC63Q8NA47 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC63Q8NA47 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC63Q8NA47 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC63Q8NA47 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC63Q8NA47 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC63Q8NA47 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC63Q8NA47 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC63Q8NA47 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC63Q8NA47 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC63Q8NA47 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC63Q8NA47 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC63Q8NA47 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC63Q8NA47 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC63Q8NA47 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC63Q8NA47 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC63Q8NA47 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC63Q8NA47 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC63Q8NA47 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC63Q8NA47 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC63Q8NA47 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC63Q8NA47 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC63Q8NA47 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC63Q8NA47 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC63Q8NA47 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC63Q8NA47 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC63Q8NA47 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC63Q8NA47 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC63Q8NA47 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC63Q8NA47 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC63Q8NA47 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC63Q8NA47 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC63Q8NA47 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC63Q8NA47 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC63Q8NA47 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC63Q8NA47 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC63Q8NA47 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC63Q8NA47 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC63Q8NA47 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC63Q8NA47 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC63Q8NA47 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC63Q8NA47 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC63Q8NA47 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC63Q8NA47 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC63Q8NA47 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC63Q8NA47 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC63Q8NA47 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC63Q8NA47 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC63Q8NA47 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC63Q8NA47 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC63Q8NA47 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC63Q8NA47 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC63Q8NA47 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC63Q8NA47 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC63Q8NA47 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC63Q8NA47 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC63Q8NA47 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC63Q8NA47 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC63Q8NA47 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC63Q8NA47 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC63Q8NA47 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC63Q8NA47 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC63Q8NA47 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC63Q8NA47 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC63Q8NA47 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC63Q8NA47 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC63Q8NA47 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC63Q8NA47 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC63Q8NA47 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC63Q8NA47 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC63Q8NA47 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC63Q8NA47 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC63Q8NA47 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC63Q8NA47 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC63Q8NA47 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC63Q8NA47 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms