Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5G0

SMIM20, Small integral membrane protein 20, humanhuman

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Length 67 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20Q8N5G0 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM20Q8N5G0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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