Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHCHD4Q8N4Q1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHCHD4Q8N4Q1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHCHD4Q8N4Q1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHCHD4Q8N4Q1 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHCHD4Q8N4Q1 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHCHD4Q8N4Q1 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CHCHD4Q8N4Q1 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHCHD4Q8N4Q1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHCHD4Q8N4Q1 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHCHD4Q8N4Q1 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHCHD4Q8N4Q1 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHCHD4Q8N4Q1 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHCHD4Q8N4Q1 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHCHD4Q8N4Q1 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CHCHD4Q8N4Q1 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHCHD4Q8N4Q1 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHCHD4Q8N4Q1 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHCHD4Q8N4Q1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CHCHD4Q8N4Q1 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CHCHD4Q8N4Q1 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHCHD4Q8N4Q1 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHCHD4Q8N4Q1 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHCHD4Q8N4Q1 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHCHD4Q8N4Q1 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHCHD4Q8N4Q1 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHCHD4Q8N4Q1 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHCHD4Q8N4Q1 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CHCHD4Q8N4Q1 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHCHD4Q8N4Q1 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CHCHD4Q8N4Q1 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHCHD4Q8N4Q1 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CHCHD4Q8N4Q1 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CHCHD4Q8N4Q1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHCHD4Q8N4Q1 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHCHD4Q8N4Q1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHCHD4Q8N4Q1 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHCHD4Q8N4Q1 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHCHD4Q8N4Q1 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHCHD4Q8N4Q1 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHCHD4Q8N4Q1 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHCHD4Q8N4Q1 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHCHD4Q8N4Q1 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHCHD4Q8N4Q1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHCHD4Q8N4Q1 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHCHD4Q8N4Q1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHCHD4Q8N4Q1 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHCHD4Q8N4Q1 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHCHD4Q8N4Q1 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHCHD4Q8N4Q1 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHCHD4Q8N4Q1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHCHD4Q8N4Q1 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHCHD4Q8N4Q1 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHCHD4Q8N4Q1 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHCHD4Q8N4Q1 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHCHD4Q8N4Q1 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHCHD4Q8N4Q1 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHCHD4Q8N4Q1 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHCHD4Q8N4Q1 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHCHD4Q8N4Q1 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHCHD4Q8N4Q1 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHCHD4Q8N4Q1 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHCHD4Q8N4Q1 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHCHD4Q8N4Q1 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHCHD4Q8N4Q1 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHCHD4Q8N4Q1 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHCHD4Q8N4Q1 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHCHD4Q8N4Q1 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHCHD4Q8N4Q1 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CHCHD4Q8N4Q1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHCHD4Q8N4Q1 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHCHD4Q8N4Q1 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHCHD4Q8N4Q1 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHCHD4Q8N4Q1 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHCHD4Q8N4Q1 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHCHD4Q8N4Q1 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHCHD4Q8N4Q1 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHCHD4Q8N4Q1 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CHCHD4Q8N4Q1 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHCHD4Q8N4Q1 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHCHD4Q8N4Q1 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHCHD4Q8N4Q1 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHCHD4Q8N4Q1 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHCHD4Q8N4Q1 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHCHD4Q8N4Q1 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHCHD4Q8N4Q1 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHCHD4Q8N4Q1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHCHD4Q8N4Q1 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHCHD4Q8N4Q1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHCHD4Q8N4Q1 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHCHD4Q8N4Q1 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHCHD4Q8N4Q1 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHCHD4Q8N4Q1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHCHD4Q8N4Q1 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHCHD4Q8N4Q1 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHCHD4Q8N4Q1 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHCHD4Q8N4Q1 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
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