Protein–RNA interactions for Protein: Q8IY92

SLX4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, humanhuman

Predictions only

Length 1,834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4Q8IY92 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLX4Q8IY92 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLX4Q8IY92 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLX4Q8IY92 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLX4Q8IY92 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLX4Q8IY92 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SLX4Q8IY92 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLX4Q8IY92 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLX4Q8IY92 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLX4Q8IY92 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLX4Q8IY92 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLX4Q8IY92 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLX4Q8IY92 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLX4Q8IY92 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLX4Q8IY92 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLX4Q8IY92 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLX4Q8IY92 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLX4Q8IY92 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLX4Q8IY92 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLX4Q8IY92 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SLX4Q8IY92 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLX4Q8IY92 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLX4Q8IY92 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SLX4Q8IY92 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLX4Q8IY92 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SLX4Q8IY92 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLX4Q8IY92 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLX4Q8IY92 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLX4Q8IY92 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLX4Q8IY92 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLX4Q8IY92 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLX4Q8IY92 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLX4Q8IY92 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLX4Q8IY92 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLX4Q8IY92 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLX4Q8IY92 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLX4Q8IY92 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLX4Q8IY92 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SLX4Q8IY92 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLX4Q8IY92 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLX4Q8IY92 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLX4Q8IY92 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLX4Q8IY92 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLX4Q8IY92 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLX4Q8IY92 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SLX4Q8IY92 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLX4Q8IY92 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLX4Q8IY92 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLX4Q8IY92 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLX4Q8IY92 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLX4Q8IY92 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLX4Q8IY92 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLX4Q8IY92 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLX4Q8IY92 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SLX4Q8IY92 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLX4Q8IY92 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLX4Q8IY92 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLX4Q8IY92 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLX4Q8IY92 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLX4Q8IY92 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLX4Q8IY92 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLX4Q8IY92 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLX4Q8IY92 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLX4Q8IY92 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLX4Q8IY92 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
SLX4Q8IY92 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLX4Q8IY92 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLX4Q8IY92 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLX4Q8IY92 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLX4Q8IY92 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLX4Q8IY92 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLX4Q8IY92 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLX4Q8IY92 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLX4Q8IY92 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLX4Q8IY92 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SLX4Q8IY92 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLX4Q8IY92 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLX4Q8IY92 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLX4Q8IY92 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLX4Q8IY92 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLX4Q8IY92 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLX4Q8IY92 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLX4Q8IY92 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLX4Q8IY92 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLX4Q8IY92 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLX4Q8IY92 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SLX4Q8IY92 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLX4Q8IY92 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLX4Q8IY92 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLX4Q8IY92 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLX4Q8IY92 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLX4Q8IY92 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLX4Q8IY92 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLX4Q8IY92 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLX4Q8IY92 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLX4Q8IY92 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLX4Q8IY92 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLX4Q8IY92 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLX4Q8IY92 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLX4Q8IY92 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms