Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV31

TMEM139, Transmembrane protein 139, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM139Q8IV31 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM139Q8IV31 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM139Q8IV31 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM139Q8IV31 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM139Q8IV31 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM139Q8IV31 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM139Q8IV31 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM139Q8IV31 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM139Q8IV31 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM139Q8IV31 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM139Q8IV31 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM139Q8IV31 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM139Q8IV31 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM139Q8IV31 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM139Q8IV31 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM139Q8IV31 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM139Q8IV31 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM139Q8IV31 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM139Q8IV31 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM139Q8IV31 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM139Q8IV31 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM139Q8IV31 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM139Q8IV31 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM139Q8IV31 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM139Q8IV31 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM139Q8IV31 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM139Q8IV31 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM139Q8IV31 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM139Q8IV31 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM139Q8IV31 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM139Q8IV31 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM139Q8IV31 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM139Q8IV31 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM139Q8IV31 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM139Q8IV31 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM139Q8IV31 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM139Q8IV31 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM139Q8IV31 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM139Q8IV31 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM139Q8IV31 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM139Q8IV31 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM139Q8IV31 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM139Q8IV31 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM139Q8IV31 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM139Q8IV31 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM139Q8IV31 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM139Q8IV31 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM139Q8IV31 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM139Q8IV31 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM139Q8IV31 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM139Q8IV31 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM139Q8IV31 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM139Q8IV31 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM139Q8IV31 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM139Q8IV31 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM139Q8IV31 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM139Q8IV31 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM139Q8IV31 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM139Q8IV31 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM139Q8IV31 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM139Q8IV31 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM139Q8IV31 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM139Q8IV31 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM139Q8IV31 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM139Q8IV31 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM139Q8IV31 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM139Q8IV31 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM139Q8IV31 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM139Q8IV31 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM139Q8IV31 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM139Q8IV31 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM139Q8IV31 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM139Q8IV31 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM139Q8IV31 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM139Q8IV31 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM139Q8IV31 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM139Q8IV31 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM139Q8IV31 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM139Q8IV31 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM139Q8IV31 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM139Q8IV31 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM139Q8IV31 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM139Q8IV31 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM139Q8IV31 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM139Q8IV31 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM139Q8IV31 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM139Q8IV31 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM139Q8IV31 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM139Q8IV31 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM139Q8IV31 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM139Q8IV31 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM139Q8IV31 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM139Q8IV31 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM139Q8IV31 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM139Q8IV31 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM139Q8IV31 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM139Q8IV31 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM139Q8IV31 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM139Q8IV31 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM139Q8IV31 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms