Protein–RNA interactions for Protein: Q86UC2

RSPH3, Radial spoke head protein 3 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH3Q86UC2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RSPH3Q86UC2 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RSPH3Q86UC2 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RSPH3Q86UC2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RSPH3Q86UC2 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RSPH3Q86UC2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RSPH3Q86UC2 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RSPH3Q86UC2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RSPH3Q86UC2 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RSPH3Q86UC2 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RSPH3Q86UC2 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RSPH3Q86UC2 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RSPH3Q86UC2 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RSPH3Q86UC2 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RSPH3Q86UC2 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RSPH3Q86UC2 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RSPH3Q86UC2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RSPH3Q86UC2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RSPH3Q86UC2 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RSPH3Q86UC2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RSPH3Q86UC2 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RSPH3Q86UC2 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RSPH3Q86UC2 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RSPH3Q86UC2 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RSPH3Q86UC2 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RSPH3Q86UC2 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RSPH3Q86UC2 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RSPH3Q86UC2 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RSPH3Q86UC2 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RSPH3Q86UC2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RSPH3Q86UC2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RSPH3Q86UC2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RSPH3Q86UC2 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RSPH3Q86UC2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RSPH3Q86UC2 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RSPH3Q86UC2 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RSPH3Q86UC2 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RSPH3Q86UC2 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RSPH3Q86UC2 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RSPH3Q86UC2 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RSPH3Q86UC2 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RSPH3Q86UC2 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RSPH3Q86UC2 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RSPH3Q86UC2 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RSPH3Q86UC2 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RSPH3Q86UC2 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RSPH3Q86UC2 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RSPH3Q86UC2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RSPH3Q86UC2 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RSPH3Q86UC2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RSPH3Q86UC2 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RSPH3Q86UC2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RSPH3Q86UC2 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RSPH3Q86UC2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RSPH3Q86UC2 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RSPH3Q86UC2 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RSPH3Q86UC2 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RSPH3Q86UC2 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RSPH3Q86UC2 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RSPH3Q86UC2 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RSPH3Q86UC2 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RSPH3Q86UC2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RSPH3Q86UC2 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RSPH3Q86UC2 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RSPH3Q86UC2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RSPH3Q86UC2 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RSPH3Q86UC2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RSPH3Q86UC2 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RSPH3Q86UC2 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RSPH3Q86UC2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RSPH3Q86UC2 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RSPH3Q86UC2 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RSPH3Q86UC2 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RSPH3Q86UC2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RSPH3Q86UC2 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RSPH3Q86UC2 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RSPH3Q86UC2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RSPH3Q86UC2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RSPH3Q86UC2 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RSPH3Q86UC2 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RSPH3Q86UC2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RSPH3Q86UC2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RSPH3Q86UC2 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RSPH3Q86UC2 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RSPH3Q86UC2 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RSPH3Q86UC2 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RSPH3Q86UC2 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RSPH3Q86UC2 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RSPH3Q86UC2 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RSPH3Q86UC2 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RSPH3Q86UC2 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RSPH3Q86UC2 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RSPH3Q86UC2 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RSPH3Q86UC2 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RSPH3Q86UC2 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RSPH3Q86UC2 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RSPH3Q86UC2 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RSPH3Q86UC2 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RSPH3Q86UC2 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RSPH3Q86UC2 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms