Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
HECW1Q76N89 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
HECW1Q76N89 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
HECW1Q76N89 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
HECW1Q76N89 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
HECW1Q76N89 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
HECW1Q76N89 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
HECW1Q76N89 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
HECW1Q76N89 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
HECW1Q76N89 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC32.28■■■□□ 2.76
HECW1Q76N89 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
HECW1Q76N89 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
HECW1Q76N89 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
HECW1Q76N89 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
HECW1Q76N89 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
HECW1Q76N89 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
HECW1Q76N89 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
HECW1Q76N89 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
HECW1Q76N89 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
HECW1Q76N89 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
HECW1Q76N89 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.76
HECW1Q76N89 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
HECW1Q76N89 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.76
HECW1Q76N89 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC32.26■■■□□ 2.76
HECW1Q76N89 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
HECW1Q76N89 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
HECW1Q76N89 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
HECW1Q76N89 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
HECW1Q76N89 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
HECW1Q76N89 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
HECW1Q76N89 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
HECW1Q76N89 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
HECW1Q76N89 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
HECW1Q76N89 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
HECW1Q76N89 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC32.26■■■□□ 2.75
HECW1Q76N89 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
HECW1Q76N89 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC32.26■■■□□ 2.75
HECW1Q76N89 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
HECW1Q76N89 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
HECW1Q76N89 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
HECW1Q76N89 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
HECW1Q76N89 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
HECW1Q76N89 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
HECW1Q76N89 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
HECW1Q76N89 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
HECW1Q76N89 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
HECW1Q76N89 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
HECW1Q76N89 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
HECW1Q76N89 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
HECW1Q76N89 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC32.24■■■□□ 2.75
HECW1Q76N89 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
HECW1Q76N89 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
HECW1Q76N89 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
HECW1Q76N89 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
HECW1Q76N89 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
HECW1Q76N89 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
HECW1Q76N89 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
HECW1Q76N89 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
HECW1Q76N89 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
HECW1Q76N89 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC32.23■■■□□ 2.75
HECW1Q76N89 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
HECW1Q76N89 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
HECW1Q76N89 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
HECW1Q76N89 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
HECW1Q76N89 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
HECW1Q76N89 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
HECW1Q76N89 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
HECW1Q76N89 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
HECW1Q76N89 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
HECW1Q76N89 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
HECW1Q76N89 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
HECW1Q76N89 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
HECW1Q76N89 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
HECW1Q76N89 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
HECW1Q76N89 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
HECW1Q76N89 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
HECW1Q76N89 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
HECW1Q76N89 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
HECW1Q76N89 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
HECW1Q76N89 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
HECW1Q76N89 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
HECW1Q76N89 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
HECW1Q76N89 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
HECW1Q76N89 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
HECW1Q76N89 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
HECW1Q76N89 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
HECW1Q76N89 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
HECW1Q76N89 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
HECW1Q76N89 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
HECW1Q76N89 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC32.2■■■□□ 2.75
HECW1Q76N89 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
HECW1Q76N89 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
HECW1Q76N89 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
HECW1Q76N89 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
HECW1Q76N89 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
HECW1Q76N89 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
HECW1Q76N89 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC32.19■■■□□ 2.74
HECW1Q76N89 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
HECW1Q76N89 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
HECW1Q76N89 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms