Protein–RNA interactions for Protein: Q76G19

PDZD4, PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD4Q76G19 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PDZD4Q76G19 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PDZD4Q76G19 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDZD4Q76G19 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDZD4Q76G19 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDZD4Q76G19 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDZD4Q76G19 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PDZD4Q76G19 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDZD4Q76G19 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDZD4Q76G19 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDZD4Q76G19 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDZD4Q76G19 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDZD4Q76G19 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDZD4Q76G19 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDZD4Q76G19 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDZD4Q76G19 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDZD4Q76G19 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDZD4Q76G19 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDZD4Q76G19 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDZD4Q76G19 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PDZD4Q76G19 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDZD4Q76G19 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDZD4Q76G19 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDZD4Q76G19 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDZD4Q76G19 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDZD4Q76G19 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDZD4Q76G19 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDZD4Q76G19 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDZD4Q76G19 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDZD4Q76G19 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDZD4Q76G19 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDZD4Q76G19 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDZD4Q76G19 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDZD4Q76G19 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDZD4Q76G19 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDZD4Q76G19 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDZD4Q76G19 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDZD4Q76G19 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDZD4Q76G19 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDZD4Q76G19 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDZD4Q76G19 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDZD4Q76G19 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDZD4Q76G19 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDZD4Q76G19 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDZD4Q76G19 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDZD4Q76G19 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDZD4Q76G19 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDZD4Q76G19 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDZD4Q76G19 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDZD4Q76G19 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDZD4Q76G19 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDZD4Q76G19 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDZD4Q76G19 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDZD4Q76G19 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDZD4Q76G19 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDZD4Q76G19 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDZD4Q76G19 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PDZD4Q76G19 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PDZD4Q76G19 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDZD4Q76G19 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDZD4Q76G19 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDZD4Q76G19 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDZD4Q76G19 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDZD4Q76G19 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PDZD4Q76G19 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDZD4Q76G19 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDZD4Q76G19 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDZD4Q76G19 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDZD4Q76G19 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDZD4Q76G19 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDZD4Q76G19 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDZD4Q76G19 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDZD4Q76G19 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDZD4Q76G19 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDZD4Q76G19 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDZD4Q76G19 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDZD4Q76G19 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PDZD4Q76G19 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDZD4Q76G19 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDZD4Q76G19 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDZD4Q76G19 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDZD4Q76G19 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDZD4Q76G19 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDZD4Q76G19 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDZD4Q76G19 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDZD4Q76G19 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDZD4Q76G19 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDZD4Q76G19 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDZD4Q76G19 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDZD4Q76G19 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PDZD4Q76G19 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDZD4Q76G19 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDZD4Q76G19 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PDZD4Q76G19 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDZD4Q76G19 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDZD4Q76G19 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDZD4Q76G19 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDZD4Q76G19 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDZD4Q76G19 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDZD4Q76G19 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms