Protein–RNA interactions for Protein: Q70EK8

USP53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP53Q70EK8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
USP53Q70EK8 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP53Q70EK8 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP53Q70EK8 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20■□□□□ 0.79
USP53Q70EK8 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP53Q70EK8 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
USP53Q70EK8 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
USP53Q70EK8 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP53Q70EK8 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
USP53Q70EK8 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20■□□□□ 0.79
USP53Q70EK8 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
USP53Q70EK8 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
USP53Q70EK8 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
USP53Q70EK8 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP53Q70EK8 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP53Q70EK8 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP53Q70EK8 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP53Q70EK8 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP53Q70EK8 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP53Q70EK8 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP53Q70EK8 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP53Q70EK8 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP53Q70EK8 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP53Q70EK8 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP53Q70EK8 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP53Q70EK8 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP53Q70EK8 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP53Q70EK8 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP53Q70EK8 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP53Q70EK8 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP53Q70EK8 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP53Q70EK8 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP53Q70EK8 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP53Q70EK8 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP53Q70EK8 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP53Q70EK8 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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USP53Q70EK8 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP53Q70EK8 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP53Q70EK8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP53Q70EK8 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP53Q70EK8 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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USP53Q70EK8 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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USP53Q70EK8 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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USP53Q70EK8 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP53Q70EK8 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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USP53Q70EK8 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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USP53Q70EK8 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP53Q70EK8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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USP53Q70EK8 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP53Q70EK8 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
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USP53Q70EK8 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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USP53Q70EK8 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP53Q70EK8 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP53Q70EK8 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP53Q70EK8 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP53Q70EK8 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
USP53Q70EK8 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP53Q70EK8 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP53Q70EK8 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP53Q70EK8 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP53Q70EK8 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP53Q70EK8 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP53Q70EK8 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP53Q70EK8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP53Q70EK8 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP53Q70EK8 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP53Q70EK8 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP53Q70EK8 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP53Q70EK8 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
USP53Q70EK8 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP53Q70EK8 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP53Q70EK8 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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