Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUS6

CCDC149, Coiled-coil domain-containing protein 149, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC149Q6ZUS6 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC149Q6ZUS6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC149Q6ZUS6 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC149Q6ZUS6 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC149Q6ZUS6 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC149Q6ZUS6 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC149Q6ZUS6 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC149Q6ZUS6 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC149Q6ZUS6 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC149Q6ZUS6 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC149Q6ZUS6 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC149Q6ZUS6 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC149Q6ZUS6 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC149Q6ZUS6 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC149Q6ZUS6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC149Q6ZUS6 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC149Q6ZUS6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC149Q6ZUS6 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC149Q6ZUS6 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC149Q6ZUS6 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC149Q6ZUS6 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC149Q6ZUS6 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC149Q6ZUS6 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC149Q6ZUS6 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC149Q6ZUS6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC149Q6ZUS6 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC149Q6ZUS6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC149Q6ZUS6 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC149Q6ZUS6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC149Q6ZUS6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC149Q6ZUS6 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC149Q6ZUS6 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC149Q6ZUS6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC149Q6ZUS6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC149Q6ZUS6 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC149Q6ZUS6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC149Q6ZUS6 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC149Q6ZUS6 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC149Q6ZUS6 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC149Q6ZUS6 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC149Q6ZUS6 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC149Q6ZUS6 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC149Q6ZUS6 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC149Q6ZUS6 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC149Q6ZUS6 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC149Q6ZUS6 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC149Q6ZUS6 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC149Q6ZUS6 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC149Q6ZUS6 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC149Q6ZUS6 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC149Q6ZUS6 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC149Q6ZUS6 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC149Q6ZUS6 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC149Q6ZUS6 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC149Q6ZUS6 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CCDC149Q6ZUS6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC149Q6ZUS6 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC149Q6ZUS6 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC149Q6ZUS6 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC149Q6ZUS6 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC149Q6ZUS6 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC149Q6ZUS6 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC149Q6ZUS6 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC149Q6ZUS6 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC149Q6ZUS6 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC149Q6ZUS6 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC149Q6ZUS6 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC149Q6ZUS6 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC149Q6ZUS6 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC149Q6ZUS6 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC149Q6ZUS6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC149Q6ZUS6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC149Q6ZUS6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC149Q6ZUS6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC149Q6ZUS6 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC149Q6ZUS6 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC149Q6ZUS6 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC149Q6ZUS6 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC149Q6ZUS6 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC149Q6ZUS6 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC149Q6ZUS6 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC149Q6ZUS6 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC149Q6ZUS6 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC149Q6ZUS6 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC149Q6ZUS6 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC149Q6ZUS6 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC149Q6ZUS6 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC149Q6ZUS6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC149Q6ZUS6 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC149Q6ZUS6 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC149Q6ZUS6 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC149Q6ZUS6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC149Q6ZUS6 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC149Q6ZUS6 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC149Q6ZUS6 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC149Q6ZUS6 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC149Q6ZUS6 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC149Q6ZUS6 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC149Q6ZUS6 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC149Q6ZUS6 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms