Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS4

CCDC129, Coiled-coil domain-containing protein 129, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC129Q6ZRS4 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC129Q6ZRS4 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC129Q6ZRS4 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC129Q6ZRS4 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC129Q6ZRS4 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC129Q6ZRS4 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC129Q6ZRS4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC129Q6ZRS4 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC129Q6ZRS4 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC129Q6ZRS4 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC129Q6ZRS4 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC129Q6ZRS4 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC129Q6ZRS4 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC129Q6ZRS4 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC129Q6ZRS4 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC129Q6ZRS4 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC129Q6ZRS4 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC129Q6ZRS4 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC129Q6ZRS4 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC129Q6ZRS4 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC129Q6ZRS4 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC129Q6ZRS4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC129Q6ZRS4 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC129Q6ZRS4 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC129Q6ZRS4 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC129Q6ZRS4 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC129Q6ZRS4 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC129Q6ZRS4 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC129Q6ZRS4 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC129Q6ZRS4 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC129Q6ZRS4 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC129Q6ZRS4 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC129Q6ZRS4 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC129Q6ZRS4 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC129Q6ZRS4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC129Q6ZRS4 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC129Q6ZRS4 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC129Q6ZRS4 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC129Q6ZRS4 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC129Q6ZRS4 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC129Q6ZRS4 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC129Q6ZRS4 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC129Q6ZRS4 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC129Q6ZRS4 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC129Q6ZRS4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC129Q6ZRS4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC129Q6ZRS4 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC129Q6ZRS4 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC129Q6ZRS4 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC129Q6ZRS4 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC129Q6ZRS4 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC129Q6ZRS4 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC129Q6ZRS4 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC129Q6ZRS4 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC129Q6ZRS4 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC129Q6ZRS4 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC129Q6ZRS4 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC129Q6ZRS4 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC129Q6ZRS4 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC129Q6ZRS4 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC129Q6ZRS4 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC129Q6ZRS4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC129Q6ZRS4 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC129Q6ZRS4 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC129Q6ZRS4 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC129Q6ZRS4 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC129Q6ZRS4 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC129Q6ZRS4 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC129Q6ZRS4 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC129Q6ZRS4 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC129Q6ZRS4 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC129Q6ZRS4 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC129Q6ZRS4 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC129Q6ZRS4 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC129Q6ZRS4 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC129Q6ZRS4 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC129Q6ZRS4 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC129Q6ZRS4 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC129Q6ZRS4 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC129Q6ZRS4 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC129Q6ZRS4 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC129Q6ZRS4 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC129Q6ZRS4 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC129Q6ZRS4 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC129Q6ZRS4 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC129Q6ZRS4 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC129Q6ZRS4 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC129Q6ZRS4 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC129Q6ZRS4 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC129Q6ZRS4 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC129Q6ZRS4 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC129Q6ZRS4 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC129Q6ZRS4 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC129Q6ZRS4 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC129Q6ZRS4 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC129Q6ZRS4 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC129Q6ZRS4 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC129Q6ZRS4 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC129Q6ZRS4 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC129Q6ZRS4 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms