Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWZ7

ABRAXAS1, BRCA1-A complex subunit Abraxas 1, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRAXAS1Q6UWZ7 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ABRAXAS1Q6UWZ7 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ABRAXAS1Q6UWZ7 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ABRAXAS1Q6UWZ7 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ABRAXAS1Q6UWZ7 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ABRAXAS1Q6UWZ7 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ABRAXAS1Q6UWZ7 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ABRAXAS1Q6UWZ7 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ABRAXAS1Q6UWZ7 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ABRAXAS1Q6UWZ7 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ABRAXAS1Q6UWZ7 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ABRAXAS1Q6UWZ7 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ABRAXAS1Q6UWZ7 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ABRAXAS1Q6UWZ7 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ABRAXAS1Q6UWZ7 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ABRAXAS1Q6UWZ7 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ABRAXAS1Q6UWZ7 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ABRAXAS1Q6UWZ7 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ABRAXAS1Q6UWZ7 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ABRAXAS1Q6UWZ7 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ABRAXAS1Q6UWZ7 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ABRAXAS1Q6UWZ7 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ABRAXAS1Q6UWZ7 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ABRAXAS1Q6UWZ7 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ABRAXAS1Q6UWZ7 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ABRAXAS1Q6UWZ7 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ABRAXAS1Q6UWZ7 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ABRAXAS1Q6UWZ7 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ABRAXAS1Q6UWZ7 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ABRAXAS1Q6UWZ7 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ABRAXAS1Q6UWZ7 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ABRAXAS1Q6UWZ7 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ABRAXAS1Q6UWZ7 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ABRAXAS1Q6UWZ7 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ABRAXAS1Q6UWZ7 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ABRAXAS1Q6UWZ7 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ABRAXAS1Q6UWZ7 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ABRAXAS1Q6UWZ7 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ABRAXAS1Q6UWZ7 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ABRAXAS1Q6UWZ7 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ABRAXAS1Q6UWZ7 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ABRAXAS1Q6UWZ7 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ABRAXAS1Q6UWZ7 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ABRAXAS1Q6UWZ7 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ABRAXAS1Q6UWZ7 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ABRAXAS1Q6UWZ7 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ABRAXAS1Q6UWZ7 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ABRAXAS1Q6UWZ7 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ABRAXAS1Q6UWZ7 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ABRAXAS1Q6UWZ7 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABRAXAS1Q6UWZ7 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABRAXAS1Q6UWZ7 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABRAXAS1Q6UWZ7 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABRAXAS1Q6UWZ7 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABRAXAS1Q6UWZ7 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABRAXAS1Q6UWZ7 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ABRAXAS1Q6UWZ7 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABRAXAS1Q6UWZ7 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABRAXAS1Q6UWZ7 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ABRAXAS1Q6UWZ7 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABRAXAS1Q6UWZ7 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABRAXAS1Q6UWZ7 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABRAXAS1Q6UWZ7 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABRAXAS1Q6UWZ7 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABRAXAS1Q6UWZ7 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABRAXAS1Q6UWZ7 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABRAXAS1Q6UWZ7 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABRAXAS1Q6UWZ7 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABRAXAS1Q6UWZ7 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABRAXAS1Q6UWZ7 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABRAXAS1Q6UWZ7 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABRAXAS1Q6UWZ7 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABRAXAS1Q6UWZ7 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ABRAXAS1Q6UWZ7 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABRAXAS1Q6UWZ7 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ABRAXAS1Q6UWZ7 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABRAXAS1Q6UWZ7 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABRAXAS1Q6UWZ7 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABRAXAS1Q6UWZ7 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABRAXAS1Q6UWZ7 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABRAXAS1Q6UWZ7 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABRAXAS1Q6UWZ7 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABRAXAS1Q6UWZ7 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms