Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SUSD1Q6UWL2 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SUSD1Q6UWL2 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SUSD1Q6UWL2 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SUSD1Q6UWL2 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SUSD1Q6UWL2 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SUSD1Q6UWL2 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SUSD1Q6UWL2 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SUSD1Q6UWL2 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SUSD1Q6UWL2 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SUSD1Q6UWL2 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SUSD1Q6UWL2 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SUSD1Q6UWL2 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SUSD1Q6UWL2 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SUSD1Q6UWL2 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SUSD1Q6UWL2 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SUSD1Q6UWL2 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SUSD1Q6UWL2 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SUSD1Q6UWL2 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SUSD1Q6UWL2 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SUSD1Q6UWL2 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SUSD1Q6UWL2 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SUSD1Q6UWL2 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SUSD1Q6UWL2 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SUSD1Q6UWL2 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SUSD1Q6UWL2 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SUSD1Q6UWL2 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SUSD1Q6UWL2 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SUSD1Q6UWL2 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SUSD1Q6UWL2 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SUSD1Q6UWL2 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SUSD1Q6UWL2 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SUSD1Q6UWL2 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SUSD1Q6UWL2 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SUSD1Q6UWL2 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SUSD1Q6UWL2 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SUSD1Q6UWL2 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SUSD1Q6UWL2 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SUSD1Q6UWL2 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SUSD1Q6UWL2 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SUSD1Q6UWL2 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SUSD1Q6UWL2 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SUSD1Q6UWL2 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SUSD1Q6UWL2 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SUSD1Q6UWL2 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SUSD1Q6UWL2 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SUSD1Q6UWL2 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SUSD1Q6UWL2 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SUSD1Q6UWL2 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SUSD1Q6UWL2 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SUSD1Q6UWL2 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SUSD1Q6UWL2 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SUSD1Q6UWL2 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SUSD1Q6UWL2 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SUSD1Q6UWL2 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SUSD1Q6UWL2 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SUSD1Q6UWL2 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SUSD1Q6UWL2 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
SUSD1Q6UWL2 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SUSD1Q6UWL2 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SUSD1Q6UWL2 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SUSD1Q6UWL2 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SUSD1Q6UWL2 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SUSD1Q6UWL2 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SUSD1Q6UWL2 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SUSD1Q6UWL2 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SUSD1Q6UWL2 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SUSD1Q6UWL2 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SUSD1Q6UWL2 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SUSD1Q6UWL2 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SUSD1Q6UWL2 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SUSD1Q6UWL2 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SUSD1Q6UWL2 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SUSD1Q6UWL2 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SUSD1Q6UWL2 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SUSD1Q6UWL2 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SUSD1Q6UWL2 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SUSD1Q6UWL2 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SUSD1Q6UWL2 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SUSD1Q6UWL2 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SUSD1Q6UWL2 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SUSD1Q6UWL2 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SUSD1Q6UWL2 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SUSD1Q6UWL2 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SUSD1Q6UWL2 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SUSD1Q6UWL2 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SUSD1Q6UWL2 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SUSD1Q6UWL2 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SUSD1Q6UWL2 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SUSD1Q6UWL2 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SUSD1Q6UWL2 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SUSD1Q6UWL2 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SUSD1Q6UWL2 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SUSD1Q6UWL2 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SUSD1Q6UWL2 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SUSD1Q6UWL2 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SUSD1Q6UWL2 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SUSD1Q6UWL2 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SUSD1Q6UWL2 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SUSD1Q6UWL2 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms