Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW56

ATRAID, All-trans retinoic acid-induced differentiation factor, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRAIDQ6UW56 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ATRAIDQ6UW56 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATRAIDQ6UW56 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms