Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW10

SFTA2, Surfactant-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTA2Q6UW10 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SFTA2Q6UW10 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SFTA2Q6UW10 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SFTA2Q6UW10 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SFTA2Q6UW10 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SFTA2Q6UW10 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SFTA2Q6UW10 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SFTA2Q6UW10 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SFTA2Q6UW10 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SFTA2Q6UW10 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SFTA2Q6UW10 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SFTA2Q6UW10 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SFTA2Q6UW10 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SFTA2Q6UW10 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SFTA2Q6UW10 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SFTA2Q6UW10 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SFTA2Q6UW10 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SFTA2Q6UW10 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SFTA2Q6UW10 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SFTA2Q6UW10 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SFTA2Q6UW10 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SFTA2Q6UW10 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SFTA2Q6UW10 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SFTA2Q6UW10 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SFTA2Q6UW10 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SFTA2Q6UW10 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SFTA2Q6UW10 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SFTA2Q6UW10 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SFTA2Q6UW10 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SFTA2Q6UW10 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SFTA2Q6UW10 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SFTA2Q6UW10 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SFTA2Q6UW10 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SFTA2Q6UW10 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SFTA2Q6UW10 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SFTA2Q6UW10 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SFTA2Q6UW10 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SFTA2Q6UW10 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SFTA2Q6UW10 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SFTA2Q6UW10 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SFTA2Q6UW10 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SFTA2Q6UW10 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SFTA2Q6UW10 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
SFTA2Q6UW10 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SFTA2Q6UW10 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SFTA2Q6UW10 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SFTA2Q6UW10 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms