Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUX4L9Q6RFH8 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms