Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q546

HUB1, Ubiquitin-like modifier HUB1, yeastyeast

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HUB1Q6Q546 BTT1YDR252W 450 nt0.55□□□□□ -2.32
HUB1Q6Q546 DPP1YDR284C 870 nt0.55□□□□□ -2.32
HUB1Q6Q546 YHR073W-AYHR073W-A 177 nt0.55□□□□□ -2.32
HUB1Q6Q546 RRT7YLL030C 342 nt0.55□□□□□ -2.32
HUB1Q6Q546 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.55□□□□□ -2.32
HUB1Q6Q546 RPB11YOL005C 363 nt0.55□□□□□ -2.32
HUB1Q6Q546 TFB1YDR311W 1929 nt0.55□□□□□ -2.32
HUB1Q6Q546 PET309YLR067C 2898 nt0.55□□□□□ -2.32
HUB1Q6Q546 YML096WYML096W 1578 nt0.54□□□□□ -2.32
HUB1Q6Q546 SLK19YOR195W 2466 nt0.54□□□□□ -2.32
HUB1Q6Q546 YCR007CYCR007C 720 nt0.54□□□□□ -2.32
HUB1Q6Q546 YDR124WYDR124W 975 nt0.54□□□□□ -2.32
HUB1Q6Q546 MTC7YEL033W 420 nt0.54□□□□□ -2.32
HUB1Q6Q546 SNL1YIL016W 480 nt0.54□□□□□ -2.32
HUB1Q6Q546 SNX4YJL036W 1272 nt0.54□□□□□ -2.32
HUB1Q6Q546 MET14YKL001C 609 nt0.54□□□□□ -2.32
HUB1Q6Q546 YAL037WYAL037W 804 nt0.54□□□□□ -2.32
HUB1Q6Q546 TEN1YLR010C 483 nt0.54□□□□□ -2.32
HUB1Q6Q546 YOR333CYOR333C 417 nt0.54□□□□□ -2.32
HUB1Q6Q546 YOR342CYOR342C 960 nt0.54□□□□□ -2.32
HUB1Q6Q546 YPR146CYPR146C 330 nt0.54□□□□□ -2.32
HUB1Q6Q546 PIN3YPR154W 648 nt0.54□□□□□ -2.32
HUB1Q6Q546 MSN5YDR335W 3675 nt0.53□□□□□ -2.32
HUB1Q6Q546 PBI1YPL272C 1554 nt0.53□□□□□ -2.32
HUB1Q6Q546 HUL5YGL141W 2733 nt0.53□□□□□ -2.32
HUB1Q6Q546 SNF5YBR289W 2718 nt0.53□□□□□ -2.32
HUB1Q6Q546 YPR117WYPR117W 7470 nt0.53□□□□□ -2.32
HUB1Q6Q546 AIM6YDL237W 1173 nt0.53□□□□□ -2.32
HUB1Q6Q546 HLR1YDR528W 1272 nt0.53□□□□□ -2.32
HUB1Q6Q546 YEL075CYEL075C 369 nt0.53□□□□□ -2.32
HUB1Q6Q546 YGR026WYGR026W 837 nt0.53□□□□□ -2.32
HUB1Q6Q546 YIP1YGR172C 747 nt0.53□□□□□ -2.32
HUB1Q6Q546 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt0.53□□□□□ -2.32
HUB1Q6Q546 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt0.53□□□□□ -2.32
HUB1Q6Q546 BAG7YOR134W 1230 nt0.53□□□□□ -2.32
HUB1Q6Q546 RPN8YOR261C 1017 nt0.53□□□□□ -2.32
HUB1Q6Q546 PAF1YBR279W 1338 nt0.53□□□□□ -2.32
HUB1Q6Q546 BIT61YJL058C 1632 nt0.53□□□□□ -2.33
HUB1Q6Q546 SRD1YCR018C 666 nt0.52□□□□□ -2.33
HUB1Q6Q546 YGL177WYGL177W 348 nt0.52□□□□□ -2.33
HUB1Q6Q546 YJL028WYJL028W 336 nt0.52□□□□□ -2.33
HUB1Q6Q546 CPR3YML078W 549 nt0.52□□□□□ -2.33
HUB1Q6Q546 CTK3YML112W 891 nt0.52□□□□□ -2.33
HUB1Q6Q546 YNL179CYNL179C 438 nt0.52□□□□□ -2.33
HUB1Q6Q546 OST2YOR103C 393 nt0.52□□□□□ -2.33
HUB1Q6Q546 MGE1YOR232W 687 nt0.52□□□□□ -2.33
HUB1Q6Q546 SHE3YBR130C 1278 nt0.52□□□□□ -2.33
HUB1Q6Q546 ZRG17YNR039C 1818 nt0.52□□□□□ -2.33
HUB1Q6Q546 MNE1YOR350C 1992 nt0.52□□□□□ -2.33
HUB1Q6Q546 TRM732YMR259C 4263 nt0.52□□□□□ -2.33
HUB1Q6Q546 MSH3YCR092C 3057 nt0.51□□□□□ -2.33
HUB1Q6Q546 SYO1YDL063C 1863 nt0.51□□□□□ -2.33
HUB1Q6Q546 SCC2YDR180W 4482 nt0.51□□□□□ -2.33
HUB1Q6Q546 MCM22YJR135C 720 nt0.51□□□□□ -2.33
HUB1Q6Q546 YLR446WYLR446W 1302 nt0.51□□□□□ -2.33
HUB1Q6Q546 YOR387CYOR387C 621 nt0.51□□□□□ -2.33
HUB1Q6Q546 FUS1YCL027W 1539 nt0.5□□□□□ -2.33
HUB1Q6Q546 PLP1YDR183W 693 nt0.5□□□□□ -2.33
HUB1Q6Q546 ARI1YGL157W 1044 nt0.5□□□□□ -2.33
HUB1Q6Q546 YHL045WYHL045W 348 nt0.5□□□□□ -2.33
HUB1Q6Q546 DIA1YMR316W 1011 nt0.5□□□□□ -2.33
HUB1Q6Q546 TOA1YOR194C 861 nt0.5□□□□□ -2.33
HUB1Q6Q546 SIP4YJL089W 2490 nt0.5□□□□□ -2.33
HUB1Q6Q546 SAS3YBL052C 2496 nt0.5□□□□□ -2.33
HUB1Q6Q546 KAP122YGL016W 3246 nt0.5□□□□□ -2.33
HUB1Q6Q546 ASM4YDL088C 1587 nt0.49□□□□□ -2.33
HUB1Q6Q546 YCR108CYCR108C 192 nt0.49□□□□□ -2.33
HUB1Q6Q546 BNA7YDR428C 786 nt0.49□□□□□ -2.33
HUB1Q6Q546 IRC19YLL033W 693 nt0.49□□□□□ -2.33
HUB1Q6Q546 DYN3YMR299C 939 nt0.49□□□□□ -2.33
HUB1Q6Q546 MEI5YPL121C 669 nt0.49□□□□□ -2.33
HUB1Q6Q546 VID24YBR105C 1089 nt0.49□□□□□ -2.33
HUB1Q6Q546 RIC1YLR039C 3171 nt0.49□□□□□ -2.33
HUB1Q6Q546 HIR3YJR140C 4947 nt0.49□□□□□ -2.33
HUB1Q6Q546 PRP6YBR055C 2700 nt0.49□□□□□ -2.33
HUB1Q6Q546 YLR149CYLR149C 2193 nt0.49□□□□□ -2.33
HUB1Q6Q546 SPR3YGR059W 1539 nt0.48□□□□□ -2.33
HUB1Q6Q546 PRK1YIL095W 2433 nt0.48□□□□□ -2.33
HUB1Q6Q546 MDM20YOL076W 2391 nt0.48□□□□□ -2.33
HUB1Q6Q546 KAP120YPL125W 3099 nt0.48□□□□□ -2.33
HUB1Q6Q546 SEC1YDR164C 2175 nt0.48□□□□□ -2.33
HUB1Q6Q546 PMI40YER003C 1290 nt0.48□□□□□ -2.33
HUB1Q6Q546 SPO74YGL170C 1242 nt0.48□□□□□ -2.33
HUB1Q6Q546 HYR1YIR037W 492 nt0.48□□□□□ -2.33
HUB1Q6Q546 HSH49YOR319W 642 nt0.48□□□□□ -2.33
HUB1Q6Q546 YPR063CYPR063C 423 nt0.48□□□□□ -2.33
HUB1Q6Q546 CUR1YPR158W 759 nt0.48□□□□□ -2.33
HUB1Q6Q546 PAU24YBR301W 363 nt0.48□□□□□ -2.33
HUB1Q6Q546 DOP1YDR141C 5097 nt0.48□□□□□ -2.33
HUB1Q6Q546 SEC63YOR254C 1992 nt0.48□□□□□ -2.33
HUB1Q6Q546 ALK1YGL021W 2283 nt0.48□□□□□ -2.33
HUB1Q6Q546 SKP2YNL311C 2292 nt0.48□□□□□ -2.33
HUB1Q6Q546 CTF18YMR078C 2226 nt0.48□□□□□ -2.33
HUB1Q6Q546 YNL034WYNL034W 1839 nt0.48□□□□□ -2.33
HUB1Q6Q546 YGL024WYGL024W 336 nt0.47□□□□□ -2.33
HUB1Q6Q546 HOP2YGL033W 657 nt0.47□□□□□ -2.33
HUB1Q6Q546 SAE2YGL175C 1038 nt0.47□□□□□ -2.33
HUB1Q6Q546 RSM26YJR101W 801 nt0.47□□□□□ -2.33
HUB1Q6Q546 YPT52YKR014C 705 nt0.47□□□□□ -2.33
HUB1Q6Q546 SRN2YLR119W 642 nt0.47□□□□□ -2.33
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 21 ms