Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Q4

LMOD2, Leiomodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD2Q6P5Q4 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LMOD2Q6P5Q4 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
LMOD2Q6P5Q4 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LMOD2Q6P5Q4 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LMOD2Q6P5Q4 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
LMOD2Q6P5Q4 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
LMOD2Q6P5Q4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
LMOD2Q6P5Q4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
LMOD2Q6P5Q4 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LMOD2Q6P5Q4 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LMOD2Q6P5Q4 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LMOD2Q6P5Q4 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LMOD2Q6P5Q4 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LMOD2Q6P5Q4 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LMOD2Q6P5Q4 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LMOD2Q6P5Q4 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LMOD2Q6P5Q4 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LMOD2Q6P5Q4 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
LMOD2Q6P5Q4 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LMOD2Q6P5Q4 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LMOD2Q6P5Q4 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
LMOD2Q6P5Q4 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LMOD2Q6P5Q4 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
LMOD2Q6P5Q4 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LMOD2Q6P5Q4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LMOD2Q6P5Q4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LMOD2Q6P5Q4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LMOD2Q6P5Q4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LMOD2Q6P5Q4 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LMOD2Q6P5Q4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LMOD2Q6P5Q4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LMOD2Q6P5Q4 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LMOD2Q6P5Q4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LMOD2Q6P5Q4 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LMOD2Q6P5Q4 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LMOD2Q6P5Q4 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LMOD2Q6P5Q4 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LMOD2Q6P5Q4 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LMOD2Q6P5Q4 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LMOD2Q6P5Q4 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LMOD2Q6P5Q4 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LMOD2Q6P5Q4 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
LMOD2Q6P5Q4 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LMOD2Q6P5Q4 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LMOD2Q6P5Q4 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LMOD2Q6P5Q4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LMOD2Q6P5Q4 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LMOD2Q6P5Q4 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LMOD2Q6P5Q4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LMOD2Q6P5Q4 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LMOD2Q6P5Q4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LMOD2Q6P5Q4 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LMOD2Q6P5Q4 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
LMOD2Q6P5Q4 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LMOD2Q6P5Q4 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LMOD2Q6P5Q4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LMOD2Q6P5Q4 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LMOD2Q6P5Q4 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LMOD2Q6P5Q4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LMOD2Q6P5Q4 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LMOD2Q6P5Q4 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LMOD2Q6P5Q4 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LMOD2Q6P5Q4 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LMOD2Q6P5Q4 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
LMOD2Q6P5Q4 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LMOD2Q6P5Q4 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LMOD2Q6P5Q4 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LMOD2Q6P5Q4 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LMOD2Q6P5Q4 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LMOD2Q6P5Q4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LMOD2Q6P5Q4 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LMOD2Q6P5Q4 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LMOD2Q6P5Q4 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LMOD2Q6P5Q4 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LMOD2Q6P5Q4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LMOD2Q6P5Q4 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LMOD2Q6P5Q4 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LMOD2Q6P5Q4 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LMOD2Q6P5Q4 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LMOD2Q6P5Q4 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LMOD2Q6P5Q4 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LMOD2Q6P5Q4 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LMOD2Q6P5Q4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LMOD2Q6P5Q4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LMOD2Q6P5Q4 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LMOD2Q6P5Q4 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LMOD2Q6P5Q4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LMOD2Q6P5Q4 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LMOD2Q6P5Q4 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LMOD2Q6P5Q4 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LMOD2Q6P5Q4 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
LMOD2Q6P5Q4 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LMOD2Q6P5Q4 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LMOD2Q6P5Q4 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LMOD2Q6P5Q4 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LMOD2Q6P5Q4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LMOD2Q6P5Q4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LMOD2Q6P5Q4 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LMOD2Q6P5Q4 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LMOD2Q6P5Q4 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms