Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZY7

CDC42EP5, Cdc42 effector protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP5Q6NZY7 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDC42EP5Q6NZY7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDC42EP5Q6NZY7 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDC42EP5Q6NZY7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDC42EP5Q6NZY7 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDC42EP5Q6NZY7 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDC42EP5Q6NZY7 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CDC42EP5Q6NZY7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDC42EP5Q6NZY7 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDC42EP5Q6NZY7 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDC42EP5Q6NZY7 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CDC42EP5Q6NZY7 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDC42EP5Q6NZY7 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDC42EP5Q6NZY7 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDC42EP5Q6NZY7 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDC42EP5Q6NZY7 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDC42EP5Q6NZY7 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDC42EP5Q6NZY7 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CDC42EP5Q6NZY7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDC42EP5Q6NZY7 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDC42EP5Q6NZY7 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDC42EP5Q6NZY7 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDC42EP5Q6NZY7 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDC42EP5Q6NZY7 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDC42EP5Q6NZY7 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDC42EP5Q6NZY7 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDC42EP5Q6NZY7 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDC42EP5Q6NZY7 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDC42EP5Q6NZY7 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDC42EP5Q6NZY7 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDC42EP5Q6NZY7 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDC42EP5Q6NZY7 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDC42EP5Q6NZY7 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDC42EP5Q6NZY7 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDC42EP5Q6NZY7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDC42EP5Q6NZY7 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDC42EP5Q6NZY7 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDC42EP5Q6NZY7 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDC42EP5Q6NZY7 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDC42EP5Q6NZY7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDC42EP5Q6NZY7 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDC42EP5Q6NZY7 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDC42EP5Q6NZY7 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDC42EP5Q6NZY7 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDC42EP5Q6NZY7 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDC42EP5Q6NZY7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDC42EP5Q6NZY7 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDC42EP5Q6NZY7 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDC42EP5Q6NZY7 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDC42EP5Q6NZY7 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDC42EP5Q6NZY7 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDC42EP5Q6NZY7 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDC42EP5Q6NZY7 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDC42EP5Q6NZY7 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CDC42EP5Q6NZY7 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CDC42EP5Q6NZY7 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDC42EP5Q6NZY7 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CDC42EP5Q6NZY7 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDC42EP5Q6NZY7 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDC42EP5Q6NZY7 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDC42EP5Q6NZY7 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDC42EP5Q6NZY7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDC42EP5Q6NZY7 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDC42EP5Q6NZY7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDC42EP5Q6NZY7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDC42EP5Q6NZY7 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDC42EP5Q6NZY7 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDC42EP5Q6NZY7 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDC42EP5Q6NZY7 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDC42EP5Q6NZY7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDC42EP5Q6NZY7 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDC42EP5Q6NZY7 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDC42EP5Q6NZY7 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDC42EP5Q6NZY7 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDC42EP5Q6NZY7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDC42EP5Q6NZY7 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CDC42EP5Q6NZY7 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDC42EP5Q6NZY7 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDC42EP5Q6NZY7 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDC42EP5Q6NZY7 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDC42EP5Q6NZY7 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDC42EP5Q6NZY7 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDC42EP5Q6NZY7 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CDC42EP5Q6NZY7 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDC42EP5Q6NZY7 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CDC42EP5Q6NZY7 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CDC42EP5Q6NZY7 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDC42EP5Q6NZY7 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDC42EP5Q6NZY7 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDC42EP5Q6NZY7 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDC42EP5Q6NZY7 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDC42EP5Q6NZY7 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDC42EP5Q6NZY7 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDC42EP5Q6NZY7 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDC42EP5Q6NZY7 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDC42EP5Q6NZY7 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDC42EP5Q6NZY7 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDC42EP5Q6NZY7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDC42EP5Q6NZY7 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms